畸形精子症的病因有精索静脉曲张、前列腺炎，精囊炎，睾丸附睾炎症、先天性畸形、原发性睾丸功能衰竭、免疫因素、毒物接触、环境因素、局部高温等。需要进一步的检查明确病因，针对性的治疗，才有治疗效果。
畸形精子的诊断与检查，体格检查：多无明显异常体征，伴精索静脉曲张者局部可有肿大或触痛，伴前列腺炎者可有触痛及结节；理化检查：显微镜下精子畸形数超过正常值的20%以上；诊断要点：凡通过精液常规全自动电脑分析仪检查，镜下精子畸形数超过20%者，即可诊断为畸形精子过多症或畸形精子增多症。本症常与前列腺炎、精囊炎合并出现。
畸形精子会影响受孕，引起症状的原因很多，包括泌尿生殖道感染、腮腺炎并发的睾丸炎、附睾结核、精索静脉曲张等均可导致畸形精子增加，阴囊局部长期高热、长期酗酒（特别是高浓度的烈性酒），生活无规律等都会引起精子畸形。畸形精子如超过70，应进行染色体检查。
男性精子畸形率过高，会影响到正常生育，查清是什么原因造成的。是睾丸先天性发育不良的因素，还是因为泌尿系统方面的病变造成的，确定病因才能进行治疗。检测工作一定要做好，千万不能忽视。
精子畸形主要是指精子的头部、中部与尾部等出现的形态变异情形，其中，头部畸形主要表现有巨大头、无定形、双头等；中部畸形有体部粗大、折裂、不完整等；尾部畸形有卷尾、双尾、缺尾等。精子高畸形率出现的症状表现为正常形态的精子数明显少于50%。畸形精子超过70%时，应进行染色体检查。精液中有支原体、衣原体感染时，精子活力降低，精子密度减少，畸形精子增多建议正规医院看，效果会比较的好。
