复方黄连素片的副作用可能会引起肠道不适引起便秘，大量食用黄连素，可能会引起恶心呕吐和发烧的症状。如果出现这些现象要停止用药，黄连素片里含有盐酸小檗碱会引起恶心呕吐，如果是备孕期一定不要服用这种药物，用药时一定要在医生的指导下。
复方黄连素片具有清热除燥，止痛止泻的作用，可以用于肠炎，痢疾，大肠湿热，里急后重等病症。而且复方黄连素片对于防治高血压，高血脂，糖尿病，心律失常等疾病都有很好的疗效，还具有一定的抗癌作用。
小檗碱是西药，但是，它的主要成分是从中药的黄连里面提取出来的，主要用于治疗腹泻的。因此，如果近期腹泻，或者平时有慢性肠炎的话，就可以服用一些的，而且副作用比较小，可以长期服用的。
它本身是属于清热解毒类的药物，所以完全可以做到清热燥湿，行气止痛的功效，但是此类药物性凉，不可长期的使用。再有一个功效就是我们大家都比较熟悉的治疗坏肚子了，我们知道其实坏肚子的原因很多，复方小檗碱治疗这些症状还是有一定疗效的，但是如果特别严重的话，还要加上一些抗感染作用强的抗生素配合使用。
可以，主要有清热燥湿，行气止痛的功效，用于大肠湿热，赤白下痢，里急后重，主要治疗急慢性肠炎、痢疾症状的，对防治高血压、高脂血症、糖尿病、心律失常有一定效果，而且还具有一定的防癌作用。
