四联疫苗接种后的不良反应多数是轻微而短暂的，包括注射局部红肿、硬结、疼痛、压痛等。有时还会出现发热、食欲不振、恶心、呕吐和腹泻等消化道症状。少数接种者还会出现皮肤瘙痒和荨麻疹，不过这些症状多数都是自愈性的。极少数儿童接种后会出现高热、惊厥，需要及时处理，以后也不要再接种后续针剂。
一般情况下，注射四联免疫后会有明显的副作用。
因为婴儿的肌肉并不饱满，而且血管很细，微循环比较弱，所以药物在体内的吸收比较缓慢，所以在注射时会受到刺激，导致注射位置出现肿胀。如果出现红肿不超过2.5cm，没有发烧或不舒服，在2-3日内会自行消化。如果红肿超过5cm，或是出现了局部的发烧和疼痛，可以用新鲜的土豆片进行冷敷，并为宝宝穿宽松的衣物，以免与衣物的接触，造成皮肤肿胀。
一般的法洛四联症，一次外科治疗就可以了，可一旦孩子的肺部和肺部的血管都很细，无法达到一定的要求。
手术前要进行脾肺分流术，大约一年后，可以重新测量左、右肺血管的大小，达到要求时，才能进行法洛四联症的手术，但若病人的肺主血管瓣环过细，导致右心室瓣环变宽，导致右心室出口变窄，手术时肺部血管瓣不能得到充分的支撑。
法洛四联症是否为遗传性疾病，到目前为止医学上不认为是遗传性疾病，因为没家族大量发现疾病，母亲有孩子有，或父亲有孩子有。但是偶尔看到，家族里上一代有心脏病，而下一代也有心脏病，数量非常少。从临床上看，大部分是健康父母生下有心脏病的患儿，经过救治大部分可以恢复。
吃完药出现恶心、头晕，可能是本身有慢性的胃炎或者胃溃疡引起，也可能由于药物作用出现的不良反应。平时饮食上可以吃点易消化的流质饮食，恶心、头晕时可以口服点胃黏膜的保护药。
感染，病毒或细菌感染，尤其是风疹病毒和柯萨奇病毒，增加胎儿心脏病的几率。此外，如羊膜病、胎儿压迫、早孕先兆流产、母亲营养不良、糖尿病、苯丙酮尿症、高钙血症、早孕时接触辐射和细胞毒药物、母亲年龄过大等都增加了胎儿心脏病患病率。
