疱疹性咽峡炎后期会咳嗽，咳嗽是人体清除呼吸道内的分泌物或异物的保护性呼吸反射动作一般由感冒引起。得了疱疹性咽峡炎不会有咳嗽反应。虽然感冒与疱疹性咽峡炎均属于急性上呼吸道感染但疱疹性咽峡炎的病灶主要在于咽、软腭、悬雍垂(口腔中软腭后缘正中悬垂的小圆锥体。
疱疹性的咽峡炎会出现咳嗽，但是此时的咳嗽往往是刺激性的干咳，不太严重，也不会太深。出现疱疹性咽峡炎的时候，咽喉部会有疱疹，所以会刺激咽喉部出现咳嗽。另外，咽喉部还会有充血和水肿，还会有少量的炎性渗出物，也会刺激咽喉部以及气管出现咳嗽。
疱疹性咽峡炎这是一种急性传染性，发热性疾病，是由许多A组柯萨奇病毒，偶尔也有其他肠道病毒所引起，其特点为疱疹性溃疡性粘膜损害。该病有流行趋势，常见于婴幼儿。临床特征为骤起高热伴有咽喉痛、头痛、厌食、并常有颈、腹和四肢疼痛。在婴儿常发生呕吐和惊厥。
双侧腋窝淋巴结肿大可以使用消炎类药物治疗，严重的需要手术切除，必要时术后进行放疗和化疗，双侧腋窝淋巴结肿大，常见的是乳腺增生所导致，因为乳腺增生，通常双侧乳房同时发生，严重乳腺增生，会出现腋窝淋巴结反应性的增生肿大，出现局部疼痛。
可能是发生后体内缺水引起的刺激性咳嗽，疱疹性的咽峡炎也会出现咳嗽，只是咳嗽的症状并不是很严重，可以口服消炎药来治疗，如果出现白细胞的升高，说明合并细菌性的感染。
可以使用抗病毒药物治疗，疱疹性咽峡炎是由于疱疹病毒感染引起的咽峡部炎症，是具有传染性的，所以首先要做好消毒隔离，避免到人多的公共场所。同时饮食上增强营养，多吃一些鸡蛋，鱼虾，瘦肉等富含蛋白的食物。
