肺栓塞通过溶栓和抗凝治疗之后大部分能痊愈，会有少量后遗症。患者出院之后还需要服用抗凝制剂药物。引起后遗症的原因，在治疗期间血栓没有得到完全的溶解或病情发生反复形成小的肺栓塞，使肺部血管变窄，形成肺动脉高压，从而导致肺心病，患者会出现心功能不全的症状，这是出现的最坏的后果。若患者出现大范围的肺梗死，就算是治愈之后，也会影响患者的肺功能，会出现活动之后呼吸困难的症状，肺栓塞患者要积极治疗，预防血栓复发，造成不可逆的状况。
行子宫肌瘤动脉栓塞术以后，可能会导致不孕不育。此外这期间会出现局部子宫肌瘤的坏死，这个过程当中会产生比较明显的疼痛，也很可能会并发感染等情况。如果症状持续加重，会导致局部产生糜烂性出血，引起阴道分泌物持续增多，甚至会出现顽固的腹痛症状，建议患者在手术以后要注意多休息，同时选择一些消炎的药物进行治疗。
肺梗死是肺栓塞的后遗症。当患者出现肺栓塞的时候，体内会启动纤溶系统，医生会根据病人的危险程度进行溶栓和抗凝。溶栓后，高风险的病人就会溶化。中、低危患者经抗凝剂治疗后，无新的血栓生成。人体的纤溶系统会慢慢地溶解这些血栓。但是，由于血栓溶解不完全、血栓机化、血管炎症等原因，肺血管重建、血管狭窄、血管阻力增加，从而引起肺动脉血栓栓塞。这就是不希望出现溶栓治疗的后果。
肺栓塞会有后遗症，症状严重会影响到生命问题，要注意积极抗凝治疗，平时注意要服用药物，平时一定要注意多休息，避免身体过度劳累的，在饮食上也要注意积极控制，不要吃辛辣刺激的食物。
肺栓塞后常见的后遗症有，肺梗塞，多因肺动脉分枝被阻塞后引起肺组织局部缺血坏死，部分因此使肺功能不同程度的下降。尽在部分病人可以形成肺动脉高压，多因反复发生小的肺栓塞或血栓未完全溶解所致。
