比较常见的副作用例如恶心、呕吐、红斑、疼痛和温热感较常见，一般在三、五天基本消失，但是对比剂多为含碘制剂，部分人会有一定的过敏反应，过敏反应常见有注射药物后出现心悸、寒战等，严重者甚至过敏性休克等，需要立即抢救。
做CT增强，所用造影剂基本上都是非离子型阳性造影剂，以碘海醇用的最多，碘海醇的商品名有欧乃派克、欧苏等。通过静脉注射到体内的碘海醇，于24小时内几乎全部药物以原形经尿液排出。注射后一小时，尿液中浓度最高。无代谢物产生。
增强核磁共振造影剂的危害主要是可能会发生血流动力学改变。有可能会引起碘过敏反应的危险，轻度的过敏反应仅表现为恶心、呕吐等，中度表现为喉头水肿、呼吸困难、荨麻疹等。
ct造影剂有副作用，CT造影剂的作用就是为了更好的显示病变，能够清晰地显示病变的强化方式，造影剂能够增加正常与异常组之间的差异，从而帮助医生发现病变，尤其是早期小的病变。
做过增强ct后三个月到六个月后开始备孕比较好。人体生殖细胞对X线反应最为敏感，如果在怀孕前接受X线照射，可使生殖细胞受到影响，严重时会出现胎儿畸形。同时备用孕期间需要补充营养。
进行普通ct扫描检查后，所受到的射线会在体内存留约一个月到一个半月的时间。多通过自身免疫系统吸收代谢，所以正常人每年平均进行4到6次ct检查是在接受正常范围之内的。个别患者因为病情需要，短时间内进行多次CT扫描检查。如脑出血患者，肿瘤手术患者，以及癌症放化疗患者，接触的放射线总量远高于正常范围内，就应该定期检查身体的各项指标，如血项常规等。
