先天性巨结肠手术后大便次数增多或失禁或胀气，说明手术创面没有完全恢复正常，肠功能比较紊乱，肠道还有炎症存在，口服消炎药，严重的情况可以进的抗生素治疗，局部热敷或者烤电，尽量多喝流质和热粥，不要吃太硬太干太凉的食物，不要吃的太饱，做到少吃多餐比较好。
巨结肠手术治疗的后遗症和并发症较为常见的为肠梗阻，排便功能障碍，肠瘘，吻合口狭窄等。并且后遗症的概率是随着年龄的增大而变大，因此在发现巨结肠后要及时的进行手术治疗。
巨结肠术后护理为术后2-3天肠道功能恢复，肛门排便排气，开始进食，开始要少食多餐，每次为正常量的三分之一，尽量与术前饮食一致。术后早期由于肛门功能未恢复，排便次数较多，每天甚至可达几十次，因此术后特别强调肛周皮肤的清洁消毒和保持干燥，每次排便后要用生理盐水，或温水洗干净并擦干。
婴儿巨结肠手术后初步的恢复要一周时间，但完全恢复可能要半年以上，术后需要一段时间的禁食水至排气，一定给他吃一些比较清淡的饮食，然后主要是进食流质饮食，尤其的饮食要避免辛辣食物。
如果宝宝一直胀气，可能是由于吃得太多造成的，也可能是由于胃肠蠕动不良造成的。总的来说，许多婴儿患有胀气，尤其是在早期阶段。事实上，没有必要拒绝成长。如果有疑问，可以去医院检查。先天性巨结肠中的一种胃肠畸形疾病。正常排便反射通常会丧失。
一般情况下，先天性巨结肠临床表现为新生儿的急性完全性肠梗阻，年长儿、青少年和成年人的慢性便秘。具体分析如下：
通常来讲，先天性巨结肠又称无神经节细胞症，是指病变肠段由于缺乏神经节细胞处于痉挛状态，导致肠内容物不能排出，近端结肠积聚粪便和气体，继而发生扩张、肠壁肥厚。对于新生儿患者来讲，其症状主要表现为出生后48小时不排胎粪，拒食，胆汁性呕吐等，此外，患者腹部膨隆，呼吸急促。而在年长儿童，青少年和成人可表现为慢性便秘，年长儿童会出现顽固性便秘，腹部膨隆，蠕动波易见，可扪及粪块儿。
