通常情况下，月经第三天查性激素六项属于经期。具体情况分析如下：
正常情况下是在月经来潮的第三到五天去医院抽血检查性激素六项，通常这个时间段属于经期，经期人体内的激素水平波动较小，比较稳定，往往可以较为准确反映身体内的内分泌的情况，如果月经结束后再去检查性激素六项，体内的激素水平迅速上升，可能会出现误差，影响到检查结果。
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性激素六项是检查整个女性性功能，内分泌轴分泌激素的情况。
性激素六项主要用于检测脑垂体分泌的激素是否正常，卵巢分泌的激素是否正常，是否有排卵以及泌乳素和雄激素的分泌。人体内分泌六种激素，分别是促排卵素、促黄体生成素、雌激素、孕激素、雄激素和泌乳素。这六个不同的时间段，可以反应内分泌的不同状况。月经来潮后2-5天要看卵巢的基本功能。雄激素和泌乳素是高是低。月经周期规律的话，一般是在月经来潮后20天左右进行检查，主要是看雌激素和孕激素是否正常。因此，在不同的时期，性激素六项会有不同的表现。
性激素六项检查时间一般是在在月经周期的第2-4天。
女性在来月经的2-4日要做血液检测。第一天是从来月经的第一天起，也就是来月经的日子，明天、后天、大后天这三天都可以做激素六项目的检测。激素六项属于较为专业的一种说法，对于普通的女人来说，并不是很好的了解。女性在来例假的2-4天身体的各种激素都处于基本的水平，这时可以进行六项检查。
经期不能检查性激素六项，需在结束后进行检查。
性荷尔蒙六项是一种很好的检测内分泌的方法。月经期间不可以进行性荷尔蒙六项检测，建议在月经后三日做一次血液检测，这是人体所有荷尔蒙处于基本水平，能够很好的反应出内分泌的状况。月经周期紊乱、月经量异常、子宫内膜增薄、子宫异常、子宫内膜异常、子宫内有异常的子宫出血等情况，需要进行性荷尔蒙六项目的检测。
做性激素六项检查需要注意空腹检查。并且需要在月经来临的2到3天抽血就可以，在经期的激素六项检查结果建议参考卵泡期的范围。在经期不要劳累，从激素水平可以判断月经紊乱的原因。
