肛镜检查有轻微的痛苦，主要是与检查水平和检查态度有关，另外，与肛门口的大小，肛门及直肠的发育程度都是有一定的关系的。掌握了技巧，动作温柔，进入的角度正确，配合良好，肛镜做好充分的润滑，疼痛不重，有轻微的胀痛感。如果肛门狭小，可能疼痛的情况就比较重。
做气管镜检查的时候，会有一定的不适感，但是，针对这种不舒服的感觉可以采取局部麻醉，使声门及会厌部的不舒适感减退，如果仍无法耐受时，也可采取全身麻醉后再做气管镜检查。
气管镜检查属于呼吸内科常用的检查方式，主要针对的是呼吸系统疾病，一般不会特别痛苦，有的患者可能反应强烈，会有恶心呕吐、咳嗽或者咽喉不适等症状。
气管镜检查需要到专业的医院进行，检查过程会更规范，动作也比较轻柔，而且现在气管镜都会进行局部麻醉，疼痛感也会减轻，如果痛感比较明显，可以进行全身麻醉，但是风险会相对比较大。
膀胱镜检查不会有太大的痛苦感，当然也不会非常的舒服了。但是为了治疗疾病，这样的检查是必须要做的。膀胱镜能够非常清楚的看到膀胱全部，这样对于之后的治疗是能有非常准确的判断，对于疾病的控制和治疗来说是很重要的一种检查手段。
不麻醉会有一定的疼痛感，如果紧张可以选择在麻醉状态下做。膀胱镜检查是将膀胱镜经尿道插入膀胱，以直接观察膀胱和尿道内病变的检查方法。手术中，需要放松心情，女性病人和用扩阴器做妇检一样，镜头可沿着尿道的生理弯曲度自然地进入，观察膀胱各个部位的病变从而进行检查。
