术后可能会出现一些并发症，也叫做后遗症。常见的后遗症为缺损的残余瘘以及纠正矫形并不完全造成的心衰，甚至会出现在手术过程中，低血压灌注造成脑部的缺血缺氧，从而使病人成为植物人的状态。这些都是手术的后遗症。
婴儿先天性的室间隔缺损如果缺损并不是很大，在1岁内有自己好的可能性。如果在1岁以后还是没有愈合，并且在5mm以内，要随时观察随访，每半年做一次体检和心脏的超声检查。如果心室缺损在5mm以上，应该每季度做一次心脏彩超检查。平时还要注意肺动脉压力的变化，如果肺动脉压力大于50mmHg，就应该抓紧时间安排手术。
临床上多主张患儿在2岁以内治疗，部分心室缺损患儿可用介入疗法来替代外科的开胸手术。多数室间隔缺损病人应尽早手术治疗，年龄以1－7岁为好，尽可能于10岁以前手术，以免出现严重肺动脉高压而失去手术机会。平时避免孩子哭闹，以免加重心脏负担和病情。
因为每个人情况是不一样的，所以具体的寿命也不能够确定，主要看是什么性质的先天性心脏病，以及采用的什么手术的，有些简单的先心病，术后可以完全恢复的且不影响寿命的。
先天性心脏病最常见的临床的症状主要是患儿生长发育明显的落后、体重增长缓慢、体格瘦小，小婴儿表现为吃奶无力、容易出汗，在秋冬季节，可能反复的呼吸道的感染、反复的肺炎，一旦肺炎还容易发生心力衰竭。
室间隔缺损是小儿最常见的先天性心脏病。正常如果说小于五毫米的缺损在三周岁之内会自习慢慢愈合的，不着急手术，超过五毫米的可能就需要手术治疗，都是选择介入封堵手术属于微创手术。
