胎儿磁共振检查是帮助患者弥补超声检查不足的方法。当下，检查胎儿、胎盘和羊水状况的主要方法为产前超声，但受到孕妇肥胖、胎儿体位等因素的影响，产科超声无法进行检查，此时就需要进行磁共振检查。磁共振可以检测胎儿有无畸形、胎盘情况、羊水情况、子宫畸形、多胎、妊娠合并子宫肌瘤、卵巢肿瘤等情况。不过在怀孕的三个月内，胎儿的各个器官都在进行发生分化，所以不宜进行核磁共振检查。
癫痫的确诊不依靠核磁共振，癫痫主要依靠病人的症状和体征来判断，另外还有癫痫的发作，是家族遗传史等核磁共振，不能确诊为癫痫，另外癫痫可以用脑电图与辅助诊断，在饮食上也要注意，不吃辛辣刺激的食物。
一般情况下，孕妇怀孕以后，有必要情况下，是可以根据病人的具体病情进行核磁共振检查的，但不建议行增强磁共振检查，也就是不建议用造影剂。
目前认为磁共振对胎儿是没有影响的，常常用于诊断胎儿看不清楚的畸形，或者用于诊断胎盘植入可疑，这时磁共振有时会看得更清楚，所以孕妇需要根据情况需要，可以在医生的指导下进行这项检查，这样可以减少因不行检查而影响病情判断后引起的相关风险的发生。
女孩做核磁共振也是非常安全的。核磁共振是磁矩不为零的原子核，在外磁场作用下自旋能级发生塞曼分裂，共振吸收某一定频率的射频辐射的物理过程。一般不会对女孩造成影响，但安装心脏起搏器的人、有或疑有眼球内金属异物的人、动脉瘤银夹结扎术的人、体内物存留或金属假体的人、有生命危险的危重病人、幽闭恐惧症患者等患者是不能做核磁共振的。
孕妇在怀孕期间最好不要做磁共振的。
一般在孕期不建议做核磁共振检查，特别是孕早期，因为孕早期是胎儿发育的最重要阶段。如果此时做核磁共振检查，磁场会影响胎儿的发育。另外有些检查需要服用造影剂，而造影剂对身体的伤害也比较大。为了安全起见，还是建议孕妇不要检查磁共振的，同时在怀孕期间一定要远离这些放射性的物质，尤其x射线，CT等。
