通常在怀孕10-13周）进行，也可以在怀孕14-24周通过羊水进行。亲子鉴定是运用医学、生物学和遗传学的理论和技术，通过分析儿童和父母的形态结构或生理功能的相似特征，分析遗传特征，来判断父母和孩子之间的关系是否属于自己。
怀孕四个月就可以进行亲子鉴定了。
在孕妇怀孕三个月以后，羊膜腔内的羊水就会逐渐形成，四个月时月时羊水基本充足，这个时候就可以进行羊膜腔穿刺，通过抽取羊水进行DNA鉴定。最好是在四个月后才进行羊膜腔穿刺，因为过早的话，羊腔膜内羊水比较少，所以穿刺起来会比较困难，而且也有可能会对胎儿造成伤害。所以一般建议最少在四个月以后进行。
通常情况下，怀孕期间可以做亲子鉴定，一般在孕4-8个月比较适合做。
具体来说，亲子鉴定主要有两个方面：羊水亲子鉴定绒毛膜亲子鉴定。
1.羊水亲子鉴定：首先要做的是，抽取羊水，从羊水中抽取脱落细胞，用试剂提取DNA物质，然后与男子的DNA进行比对。
2.绒毛亲子鉴定：一般在怀孕八周后进行，需要提供母亲的样本进行绒毛检测，然后提取样本细胞核中所含的DNA，再进分析。担忧已孕初期胚胎发育不成熟，绒毛穿刺易引发流产，一定要在正规医院，由专业医生进行检查。
怀孕亲自鉴定费用在1-3千元左右。
孕妇在怀孕40天后即可通过抽取孕妇的静脉血来提取胎儿的dna，从而进行亲子鉴定，也可以在怀孕四个半月左右进行无创DNA检查或是羊水穿刺的同时进行亲子鉴定，一般是较为准确的。亲子鉴定出结果的时间和缴纳的费用有一定关系，如果缴纳的钱较多，出结果的时间较快，如果较少，则会相应延长。
怀孕四个月羊水充足，这时候可以通过羊膜腔穿刺，抽取羊水做DNA鉴定，也就是常说的亲子鉴定。如果时间更早，因为羊水比较少，穿刺起来有些困难，也有可能会损伤到胎儿。怀孕时间更晚，羊水量充足，可以在超声波定位下穿刺抽取，操作起来比较简单，也不会影响到胎儿。
