脑炎确诊做腰穿主要是明确患上的是什么脑炎。
腰椎穿刺检查是确诊脑炎的必要条件。因为有时候，病毒性脑炎、结核性脑膜炎、真菌性脑炎等都很难通过临床症状来判断。腰椎穿刺能直接看到脑脊液颜色，直接测量脑脊液压力，对鉴别脑炎具有重要意义。腰穿脑脊液化验，如果能够培养出相应的致病细菌，对于确诊脑炎非常重要，患者通常会在明确病情后对症治疗。
诊断出脑炎，需要进行腰椎穿刺，因为腰椎穿刺可以保留脑脊液进行化验。
脑炎的病人通常需要进行脑脊液的检查来确定脑炎和脑炎的病因。因此，要确诊脑炎，首先要做好腰椎穿刺检查，有留取脑脊液，主要是看病人颅内脑脊液细胞数、蛋白数、颅内压力等情况。
一旦确诊为脑炎，就要进行抗感染的药物，在治疗期间患者需要注意休息，避免劳累。
腰穿是临床上比较常见的穿刺术，操作简单，穿刺过程中会对穿刺部位进行局麻以减轻患者疼痛。很多患者由于怕痛而拒绝腰穿，但实质上整个过程是非常快速的，说一点都不痛肯定是不可能的，但绝对是可忍受的，可能进针的时候会有一点痛感，但毕竟进行了局部麻醉，所以患者不必太紧张。
腰穿脑脊液检查是诊断神经疾病的一个重要方法。事实上腰穿后遗症这一说法是不准确的，所谓后遗症是长期不能恢复的症状，遗留的问题，如脑梗、脑膜炎等可能出现后遗症。不论大人小孩，做腰穿虽然有风险，有的是在穿刺当时或术后短时间内出现，比如麻醉药过敏，术中神经损伤疼痛，有的时间稍长，如低颅压综合征、感染，但一般通过治疗都能好转治愈。
椎体外系肌张力障碍做腰穿能确诊。锥体外系之肌张力之紊乱，常以帕金森病为多见。
通常情况下，帕金森病患者可表现为肌张力障碍，并有动作缓慢，姿势不正常等，然后，通过腰穿，主要目的就是要消除一些其他继发性病变，则部分病人经脑脊液检查，可排除部分颅内感染，或有些是由于存在肿瘤引起副肿瘤综合征，致使肌张力受阻。另外也有部分患者会因为嵴柱畸形造成的肌张力的异常而表现出来，但是这些都不是很明显的症状。
在一般情况下，病人得诊断需与病人病史相结合，对应辅助检查、体格检查。有些病人可能还需要结合对病人基因进行测试来诊断，纯粹靠腰穿通常情况下，未必能证实病人属何种肌张力之障碍。
腰穿检查是神经内科最常用的检查方法，用于诊断某些疾病，收集脑脊液送检。主要用穿刺针穿刺腰椎间隙，抽取脑脊液化验，测量脑脊液压力。一般需要20分钟左右，这要看术者的熟练程度和患者的腰椎情况。如有腰椎间隙狭窄、脊柱侧弯、腰椎骨折等特殊情况，一般穿刺较为困难，耗也会比较时长、甚至还可能有失败可能，需要患者到正规的医院接受治疗。
