巧克力囊肿的主要原因是因为患有子宫内膜异位症，在卵巢周围的子宫内膜发生出血不断的积聚就慢慢形成了巧克力囊肿。这种囊肿手术治疗后很容易复发。建议在手术治疗的同时使用药物进行人工绝经的治疗。
做完巧克力囊肿手术后要注意：首先是按照医生说的按时吃用药物，定期复查肝功能，生活上要注意好好休息一个月，一个月内不能性生活，不能盆浴，不能游泳。不要吃冷冻的食物，不要抽烟喝酒，饮食生活规律，多吃蔬菜水果，适当的吃鱼肉蛋，不要吃用刺激性的食品，少喝咖啡和浓茶等饮料。
巧克力囊肿术后半个月能冲凉碰水，术后需要保持伤口清洁，干燥等伤口完全愈合后，方可淋浴，每天一定要注意伤口有无红，肿，热，痛的现象，以防感染发炎的发生，要及时注意并且发现。
巧克力囊肿是由于子宫内膜异位症导致的，异位的子宫内膜随着月经周期发生周期性出血，由于血液不能排出，所以形成类似巧克力状的物质。巧克力囊肿需要手术摘除，一般选择的是腹腔镜手术，属于微创手术，术后身体恢复比较快，并且巧克力囊肿的切除手术不会影响到生育。
巧克力囊肿微创术手术后做了疏通手术，还是按照医生的叮嘱两个月后才同房。首先是从感染和排卵的角度考虑的，因为性交可能会带入一些细菌之类的，会导致伤口的感染，影响到正常的康复，如果是排卵，也不利于怀孕，所以还是建议2个月后才考虑性生活的。
