一般情况下，女性阴道炎久治不愈的主要原因包括以下：一，女性不按医生的要求，未系统的用药治疗，随意中断药物使用。二，用药治疗期间，女性不注意个人卫生，并且还有性生活，这样会影响治疗效果，也会久治不愈。三，炎症需要夫妻双方同时用药治疗，如果只有女性治疗，性伴侣仍然会携带病菌，性生活后还会再次感染。四、盲目的用药治疗，没有明确是何种致病菌便随意用药，产生耐药性。
治疗霉菌性阴道炎，如果治疗不彻底，就会有反复发作的特性，所以应该彻底治疗，可以用一些药物冲洗阴道，然后阴道里上也针对性的使用药物，如果平时有脚气感染，也应该积极治疗，以防止交叉感染，治疗期间禁止性生活，如果有性伴侣也应该积极治疗。
阴道炎久治不愈通常有以下原因：
首先可能是没有做详细的细菌培养，因此所选择的药物针对性不强才会出现久治不愈。但也有可能是不讲究个人卫生、未做到每天用温水清洗外阴、不及时更换内衣及内衣未用开水烫洗。也有可能是在治疗过程中随意停药，阴道炎治疗不彻底，会再次造成菌群失衡，才会导致久治不愈。最后也有可能是进行性生活时未注意卫生或者是另一半卫生情况不达标存在疾病如龟头炎等。
阴道炎久治不愈首先要检查一下白带常规，可以明确具体的阴道炎类型，然后针对性的治疗。
阴道炎在治疗期间，一定要按照医嘱用药，如果症状缓解，通常不能马上停药，因为停药容易造成慢性炎症，迁延不愈。治疗时通常需要连续三次月经干净以后复查白带常规，检查结果是阴性才可以考虑停药。
需要注意，如果阴道炎久治不愈，还可以使用调节阴道内环境的药物，比如定君生。
治疗用药不规律、疗程不够、剂量不足，未能定期复查、未确定病愈就停药，不能完全杀灭病原体，残存病原体在局部可以继续繁殖，使症状无法缓解导致反复发作，不能痊愈。炎症为混合感染而引起，单用针对一种病原体的药物不能杀灭混合感染的病原体，可能会导致阴道内菌群严重失调，耐药菌株产生，为治疗带来困难。长期应用广谱抗生素或激素治疗，易造成机体抵抗力下降，菌群失调，可使阴道炎难以治好。