脑脊液用于检查脑炎，主要是腰椎穿刺。它经常被用来检查脑积液的性质。一般它最适合于髂后脊柱和后中线的连接处。当局部注射麻醉药品被刺穿时会有一点疼痛，但一般病人可以忍受。手术后的病人躺在枕头上休息4-6个小时，以避免手术后引起头痛。
通常情况下，腰穿脑脊液查颅内压是否升高、中枢神经系统感染、蛛网膜下腔出血等。
脑脊液是存在于脑室及蛛网膜下腔的一种无色透明的液体，比重为1.005，总量为130～150ml，平均每日产生量为524ml，通常包围并支持着整个脑及脊髓，有效地使脑的重量作用减少至1/6，对外伤起一定的保护作用。而腰穿脑脊液，一般是查颅内压是否升高、中枢神经系统感染、蛛网膜下腔出血等。
脑脊液外漏轻微时3-4天会好，如果情况比较严重，可能一两个月才能好。
根据患者的病情发展趋势，通常有脑脊液鼻漏、耳漏等都要卧床休息，并及时进行止血、补液、改善脑循环、脑保护等。在这样的情况下，大多数的病人都会得到比较好的恢复，除非是脑脊液漏很严重，七天之内不见好就可以进行腰椎穿刺，如果七天后还没有好转，就应该做外科手术来修复。
一般情况下，脑脊液生化检查以下内容：
脑脊液的生化检测包括脑脊髓液中蛋白含量、糖含量、氯化物含量等。在这些因素中，糖分和蛋白质含量是一个比较关键的参数。大多数的脑炎、脑膜炎等都会导致脑脊液中的糖水平下降；但是也有一些特定的疾病，比如病毒性脑膜炎等，可以引起脑脊液中的白细胞和蛋白质数值增高，但是糖份的浓度还在正常范围之内。
神经梅毒脑脊液检查包括，细胞计数检查，蛋白质的测定及抗心磷脂抗体试验。细胞计数可以检测出中枢神经系统有无炎症现象，同时检测脑脊液中的Ig及高分子的蛋白有助于评价神经梅毒的活动性。
腰穿取脑脊液是有风险的。如果是后颅窝病变，或者是高颅压，那么腰穿很有可能会引起脑疝，这是因为在释放脑脊液后，蛛网膜下腔的压力会下降，大脑组织会下沉，从而引起脑干在枕骨大孔处的嵌顿。脑疝可引起中枢性的呼吸循环紊乱，严重威胁到病人的生命。另外，有颅内动脉瘤的病人，由于腰穿压的改变，会引起动脉瘤破裂出血。其它的危险包括穿刺损伤，局部感染，低颅压头痛，麻醉药物过敏。
