对于唇腭裂患者的最佳手术时间，原则上是越早治疗越好。唇裂手术在患者机体免疫力健全的情况下，最早可在出生后24小时内手术，也可在出生3个月后，因为这时不仅婴儿的免疫力较强，可以耐受感染，而且这时机体的组织细胞也都很幼稚，不易形成瘢痕，为术后畸形恢复，创造良好的条件。而腭裂手术最早也要在婴儿出生后6个月以后进行。
一般在4到6周，胎儿的面部逐渐发育的时候形成的，兔唇是一种先天性遗传病。如果在直系亲属和胎儿的相关家庭成员中有兔唇病人，可能导致胎儿患上这种疾病。此外，环境因素也是兔唇形成的重要原因之一。怀孕期间，如果孕妇有药物过敏、病毒感染、厌食、吸烟和被动吸烟、饮酒等引起的维生素C缺乏，胎儿可能患兔唇病。
胎儿唇腭裂形成时期主要是怀孕头3个月，这段时间是非常重要的，如果孕妇缺少叶酸就会容易导致胎儿畸形，另外如果缺少维生素A和B可导致新生儿先天性唇裂、腭裂，这些都是需要特别关注的。
唇腭裂是母亲在生长发育过程中一些不利因素造成的。这些因素可归纳为遗传因素和环境因素两大类，临床实践中经常发现唇腭裂患儿，在其直系或旁系亲属中，也有类似的畸形，这是由于某个基因的突变造成的。环境因素指的是胚胎生长发育的环境。母体是胚胎生长发育的温床，如果母体受到外界的干扰，就会影响胚胎发育。
遗传因素，唇腭裂的患者往往在其直系或旁系亲属中也可发现类似的畸形。营养因素，各种因素导致的孕妇维生素缺乏都会引起胎儿唇腭裂的发生。感染损伤，内分泌紊乱以及药物因素都会导致胎儿畸形。孕妇频繁接触x线或微波等，都有可能引起胎儿发育异常而导致唇腭裂的发生。有研究表明，吸烟饮酒也会造成胎儿唇腭裂的发生。
