复发几率不大。巧克力囊肿术后人的对侧卵巢或同侧卵巢可能有新的病灶，医生又要开始重新用药，甚至有可能要面临再次手术。如果这种病人做过2-3次的手术以后，卵巢体积就会缩小，也就预示着卵巢功能会下降，将来有可能面临早绝经，或者卵巢的抗缪勒氏管激素会下降，卵巢的储备功能下降。
去医院憋好尿做腹部彩超检查，到妇科医院通过正常的常规检查就可以查出来。单纯卵巢囊肿的治疗方案要到医院进行全面检查后根据囊肿大小位置进行选择，如囊肿直径小于5厘米，又无证据提示肿瘤，多为功能性囊肿，可以密切随访，即2－3个月检查一次，以后再调整检查间隔时间，若囊肿直径大于5厘米，则多为卵巢肿瘤，一般需要手术治疗。
防止甲状舌管囊肿术后复发在手术中需要进行切开引流。
如果出现感染，应在2-3个月后进行瘘管切除，或进行甲状舌管囊肿切除。想要彻底的根治，首先要做好脓肿的切开引流，然后进行外科手术，去除甲状舌管囊肿需要将舌骨的中段和后面的肌肉和舌骨的盲孔全部切除，这样就不会再出现复发的情况了。并且患者在术后还需要做好护理工作，避免出现感染。
腱鞘囊肿术后3个星期之内不能做任何激烈的运动，特别是关节部位的剧烈、频繁的活动会引起肌腱鞘囊肿的反复发作，由于术后的局部组织尚未完全复原，过度的活动会造成大量的粘液流，从而使术中软肋部位出现囊肿。一些病人在手术中可能会出现粘连等症状，主要是因为长期的受限运动，所以要进行功能锻炼和康复治疗。经过积极的处理，可以得到显著的减轻或者回到正常人的状态。
因为卵巢囊肿种类很多，有上皮性肿瘤，复发率较低一些，如果是子宫内膜异位囊肿，就是俗称巧克力囊肿，复发率是很高的，所以做巧克力囊肿术后必须进行药物治疗。药物治疗期限三个月到半年，这个期限，咱们大大降低它的复发率。卵巢囊肿一旦复发，首先要观察生长的速度，如果生长的速度仍然很快，二次进行手术，如果生长速度很慢，就可以进行药物治疗。药物治疗可以用一些中药、蒙药治疗，都是用舒筋活血的药物。
腱鞘囊肿手术后复发可以进行二次手术。
术后出现的肌腱鞘囊肿复发，需要进行第二次外科切除。不过，做完这台手术，疤痕粘合的情况并不好。因此，在做完这一系列的手术之后，一定要谨慎地进行分离，避免对周围的神经和血管造成的伤害，术后要多休息，避免出现反复。伤口要及时进行换药和杀菌。要做好局部护理工作，注意休息。
