改善肠道微生态环境，应明确原因后对症处理，可用肛管排气方法；继续母乳喂养，鼓励进食。腹泻严重或呕吐严重者，可暂禁食4～6小时，但不应禁水。禁食时间≤6小时，应尽早恢复饮食。合理饮食，维持营养；迅速纠正水、电解质平衡紊乱；控制肠道内外感染；对症治疗加强护理、防治并发症；避免滥用抗生素。
有些肠炎会伴有发热，出现发热的情况给予退热处理，可以口服一些调节肠道内环境的药物，也可以口服一点中医的健脾药物，大部分轻度小儿肠炎可以缓解。对于比较严重的肠炎，如果小宝出现精神萎靡、高热不退、小便减少、大便一天在十几次以上，伴有眼窝塌陷、口唇发绀，就会伴有脱水情况。脱水是小儿肠炎容易出现的一个临床并发症，要及时补充液体。
腹泻是结肠炎的主要表现。药物是主要的治疗方法，如果有需要，可以选择手术。对于结肠炎的病人，可以选用5-氨基水杨酸类的药物，例如柳氮磺比啶，尤其是轻、中度结肠炎的病人。
如果已经服用了柳氮磺比啶，但是没有明显的改善，或者是病情比较严重的，可以选择强的松、地塞米松等糖皮质激素。另外还需要注意补充水分，保持体内的水份平衡。如出现出血、穿孔或阻塞，应考虑外科手术。
在给宝宝吃药治疗的同时还是要给宝宝注意一下饮食的，要多给宝宝喝一些水，饮食尽量清淡一些，不要吃那些不容易消化的食物。处于哺乳期的话，宝妈也要注意饮食，别吃辛辣刺激的食物。
宝宝胃肠炎拉肚子需要口服或者输液抗生素来进行治疗。也可以口服中药，适用于消化不良，食欲不振，营养不良，肠道菌群紊乱引起的腹泻，便秘，腹胀，肠道内异常发酵肠炎使用抗生素引起的肠粘膜受损。
拉肚子指腹泻。小儿腹泻不一定是肠炎，腹泻与肠炎有一定区别。
小儿肠炎主要是由于自身免疫能力差，容易感染，也可能是遗传原因，主要是由于感染了病毒和细菌。轮状病毒、诺如病毒、柯萨奇病毒是最常见的，还有大肠杆菌、空肠弯曲杆菌、沙门菌、金黄色葡萄球菌等细菌感染。
肠炎是由原虫和真菌引起的，儿童腹泻一般会突然出现，出现发热、腹痛、便后下坠、粘液便、脓血便等。大便后腹痛不会减轻，是有传染性的。感染的方式是患者、带菌者的排泄物、苍蝇等。因此，生活用品，如餐具，儿童玩具，饮料等都会传播给别人。
