采用微创手术治疗较彻底，卵巢巧克力囊肿是子宫内膜异位症的一种病变，会导致痛经，月经不调，影响怀孕，如果应用药物治疗有明显的见小可以再应用一段时间，如果不好建议还是采用微创手术进行治疗较好，不会影响生育问题。
这样的病症如果是通过手术治疗之后，又复发了，应该查找其复发的原因。可以去检查一下体内的激素水平，看看是不是有这类的原因引起的，如果与此有关，就要调理自己的内分泌状态。
巧克力囊肿术后饮食，没有什么明显的饮食禁忌，对于新鲜的水果、蔬菜、鱼、虾、瘦肉、鸡蛋、牛奶均可以食用。但是对于比较特殊的食物，比如豆制品、豆浆、蜂王浆，尽量减少食用或者是不食用。
巧克力囊肿如何检查问题，需要做的检查有：阴道后穹隆穿刺。这种检查可以抽出咖啡色或者是巧克力色浑浊液，甚至有的是血性液体。抗子宫内膜抗体，这是一种以子宫内膜为靶抗原，可以引起一系列的免疫病理反应的一种自身的抗体，是子宫内膜异位症的一个标志抗体。B型超声检查。这种检查方法可以看见附件区和子宫密切相连的地方有一个轮廓不规则的囊腔，其液性暗区中充满弥漫性的杂乱细回声，或者是不均匀的片状回声。
手术后2个月内复查。如果你想检查卵巢囊肿，通常在月经干净后通过b超检查。与上一个结果相比，是否有渐进增长。如果典型的卵巢子宫内膜异位症囊肿可以通过病史、妇科检查结合B超诊断，但这不是金标准。其实有些卵巢子宫内膜异位囊肿的诊断比较困难，甚至需要腹腔镜诊断。
巧克力囊肿复发有腹痛、腰痛或下肢疼痛的症状，肿瘤浸润或压迫周围组织。如果盆腔静脉压缩，下肢可能会肿胀。如果是功能性肿瘤，就会出现相应的或高雄激素性巧克力囊肿的症状。恶性巧克力囊肿也可能发生在女性卵巢，但其症状与巧克力囊肿不同。
