指甲有小坑可能是外伤、贫血、营养不良等情况所致，需要根据具体的情况来处理。
如果是因为被重物砸到造成的，一般是不要处理的，等一段时间后后新指甲生长出来就会正常。如果指甲有小坑是因为患者长期的贫血，造成的匙状甲疾病，这种情况要注意多吃些补气血的食物。生活中也要做好指甲防护工作。如果指甲有小坑是由于身体营养不良，造成指甲生长缺乏导致的，那么患者要注意补充些富含蛋白质、维生素、钙元素的食物例如瘦肉、牛奶等，促进指甲健康的生长。
一般情况下，指甲上很多小坑可能是缺钙、真菌感染等因素造成的，具体内容如下：
1.缺钙：挑食、节食等因素可能导致患者出现缺钙的情况，可能导致患者指甲上很多小坑。患者可以遵医嘱使用葡萄糖酸钙口服溶液等药物进行治疗，也可以吃一些牛奶、红枣等来补钙。
2.真菌感染：真菌感染可能诱发甲癣，可能导致患者甲面方式变化，可能出现指甲上很多小坑的情况。患者应及时就诊，遵医嘱进行抗真菌治疗，以免耽误病情。
指甲上的小坑是一种常见的疾病，也叫甲凹点，在临床上是常见的，比如甲凹点，扁平苔藓甲改变，或者是自身免疫导致的掌跖脓疱病甲损害，也可以是连续性肢端皮炎。可选择如下方式治疗：
1.如果出现严重的手部湿疹、甲周营养不良等情况，也会导致甲营养不良。甲面出现甲凹点，需要结合其他疾病进行甲凹点的诊断，对症治疗。
2.当然还有一种情况，如果没有其他的疾病，身体很好，那么这个生理上的甲凹点也是有可能的，但是这个情况不需要特殊治疗，只需根据病情来用药处理即可。
一般情况下，指甲盖凹凸不平有小坑可能是真菌感染、营养不良等原因导致的。
1.真菌感染：创伤后可能会导致指甲被真菌感染，造成甲癣，此时可能会出现指甲异常生长的情况，导致指甲盖凹凸不平有小坑。
2.营养不良：如果缺乏营养，可能会导致甲营养不良，造成指甲生长比较慢，导致指甲盖凹凸不平有小坑，平时要适当补充营养，多休息。
手指甲上有小坑多考虑有真菌感染，继续发展下去，指甲会出现灰指甲等真菌性甲藓。可以外用药，有脚气的话，早点治疗脚气，避免用手指甲接触有脚气的脚。避免吃辛辣油腻刺激性食物，不要吃海鲜和牛羊肉。
指甲不平和凹陷可能由指甲营养不良疾病引起，可能与长期接触过敏物质、维生素和微量元素不足及其他因素有关。需要去皮肤科进行诊断和治疗。诊断清楚后，应该听从医生的治疗处方。注意均衡饮食，不要挑食。补充维生素和微量元素。