治疗如单纯用一般抗炎疗法，效果常不理想，故多主张采取用抗生素离子局部透入及精囊封闭疗法。对局部症状严重，而又久治不愈者，可考虑切除。若伴发前列腺炎、精囊炎应同时治疗。
慢性附睾炎应根据细菌培养及药敏试验选择药物。局部热敷或理疗，以促进炎症消退。对于反复发作的慢性附睾炎，可考虑附睾切除或输精管结扎，平时应该吃一些抗菌消炎的食物和吃清热解毒的食物，还有能增强免疫力的食物。
首先出现慢性的附睾炎，需要积极的进行药物治疗，可以选择一些消炎的药物来治疗，按疗程进行用药，才能够达到很好的治疗和康复的效果，同时应该保证足够的休息，不要劳累，饮食上不要吃辛辣有刺激性的食物，才能达到很好的效果。
慢性附睾炎单纯应用药物效果不一定理想。除应用有效广谱抗生素外，局部热敷等物理治疗也是很有必要的。也可以采用附睾局部应用新霉素等离子透入治疗。若有慢性前列腺炎，必须同时进行治疗。反复发作来源于慢性前列腺炎的附睾炎，可考虑结扎输精管后再进行治疗。对于多次反复发作者，也可考虑做附睾切除术。
慢性附睾炎病人，炎症多继发于慢性前列腺炎或损伤，病人常感患侧阴囊隐痛，胀坠感，疼痛常牵扯到下腹部及同侧腹股沟，有时可合并有继发性的鞘膜积液。检查时附睾常有不同程度的增大变硬。有轻度压痛，同侧输精管可增粗。
