治疗卵巢囊肿是从整体观入手，硫肝理气，扶正因本，活血化瘀，软坚散结，清热解毒，全面调节内分泌使气面血活，活跃脏腑，经络为本，气血为用，气血是肌体的物质基础，脏腑是气血生化之源，起着分管血的生成，统摄与运行。
一般情况下，卵巢囊肿患者可以通过医学检查、手术治疗等方式进行治疗。具体情况分析如下：
如果是直径在5cm以下的卵巢囊肿，同时检查CA125、CA19-9、CEA、AFP等指标是否在正常范围内，可以在月经结束后进行妇科彩超检查。如果是一个直径超过5cm的卵巢囊肿，同时还要做妇科彩超检查。卵巢囊肿外科治疗通常是对有需要或尚未绝经的妇女，应行腹腔镜下摘除或剖腹切除。如果是绝经期后的妇女，或者是因为有恶性肿瘤的原因，需要进行手术治疗。
卵巢囊肿可以分为病理性的和生理性的，生理性的卵巢囊肿一般比较小，而且不会引起明显的身体不适，月经推迟不一定就是由卵巢囊肿引起的。当月经推迟时，有性生活的育龄期女性首先要排除是否存在已经怀孕的情况。如果可以排除怀孕，月经推迟7-10天一般是正常现象，如果月经推迟超过10天，可去医院做个妇科B超检查，排除病理性囊肿。
卵巢囊肿根据大小、位置、性质不同，治疗方法不同。一般以手术治疗为主，要看是否恶性，囊肿的部位，体积，大小和生长速度。如畸胎瘤，B超、平片检查可发现牙齿、骨头等特殊结构，肿瘤超过3-4cm需要进行手术处理。其它囊肿、肿瘤并无此典型表现。
如果在怀孕之前或之后没有发现卵巢囊肿，则左侧卵巢囊肿在怀孕三个月后出现。这可能是由于怀孕期间体内的激素水平。目前，卵巢囊肿的大小应首先确定。如果囊肿非常小，不能治疗，可以进行定期检查。如果囊肿很大，就可能导致流产。有必要结合自己的临床诊断，看看是否需要继续妊娠。
