要选用质子泵抑制剂、H2受体阻断剂、抑酸剂或胃黏膜保护剂。可以单独应用，也可以联合应用。如果明确存在幽门螺旋杆菌感染，还应当采取三联或四联疗法。如果幽门水肿引起了幽门梗阻，这时应当禁食，持续胃肠减压，在应用药物治疗的同时还应当考虑进行盐水洗胃，减轻水肿症状。
幽门水肿是因为胃幽门部位存在组织液渗出引起了局部粘膜组织水肿，如果是炎性的渗出会刺激周围的粘膜，引起炎症性的疼痛，一般这情况是长期慢性炎症刺激而导致的，加上存在着慢性胃炎的情况，所以说造成了幽门水肿。
水肿可分为轻、中、重三级。轻度水肿不超过膝关节，中度水肿为整个下肢。重度水肿为全身水肿。水肿要排除心脏、肝脏、肾脏、甲状腺等导致水肿。可以到医院检查心脏彩超、肝脏B超、肾脏B超，行肝功能、肾功能、甲状腺功能等检查，以明确诊断。
胃窦黏膜充血水肿，这是在胃镜下发现的，多提示为胃窦炎，与进食不注意、胃酸过多或伴有幽门螺杆菌感染有直接关系，这种病并不算严重。一般轻症的胃窦炎在控制饮食后都会自行缓解，饮食上要少吃辛辣、油炸等刺激性的食物，戒酒。
消除水肿的方法有很多种，首先需要确定是由于什么原因而导致的水肿，如果是由于局部的感染而引起的水肿，可以使用抗生素药物治疗，如果有伤口，也可以给予酒精湿敷。如果是由于贫血或者低蛋白血症而导致的水肿，需要给予输血输蛋白静脉可以给予脱水药物来治疗。如果是由于静脉瓣膜功能受损而导致的，可以使用活血化瘀的药物来治疗，如果是由于肿瘤性的原因，压迫血管而导致的水肿，可以给予放疗，化疗等治疗方式。
