不会影响的。巧克力囊肿是卵巢的子宫内膜异位症囊肿。每个月，随着月经来潮出血，子宫内膜出血，在卵巢内部形成巧克力液体，每个月随着月经来潮增大，为了防止破裂必须手术剥离囊肿穿刺。但是手术也不能治疗好。只要月经正常，卵巢功能正常，就会复发。
打算要孩子，巧克力囊肿手术之后，连续用3到6个月，打针期间是不能怀孕的。克力囊肿是子宫内膜异位引起，严重时可以导致组织器官黏连引起不孕。现在手术后打针考虑是为了减少复发。打针期间有正常的性生活，没有避孕的情况下，是可以有怀孕的几率。打针防止复发的药物没有避孕的作用。只要是有精子和卵子结合，就可以怀孕。
巧克力囊肿可以做B超检查，通过B超检查能够发现囊肿的大小以及位置，可以看见囊肿的具体部位，还可以判断囊肿内部的具体性质。初次前往医院检查的时候需要进行常规的妇科检查，比如三合诊检查、双合诊检查，这种检查可以发现囊肿的存在。
巧克力囊肿术后是能怀孕，所以不要担心，需要看一下平时的月经情况的，怀孕前需要全面体检看一下，注意看看经期的情况是否规律或者预防囊肿反复的情况，巧克力囊肿，属于子宫内膜异位症的一种临床表现。因为妊娠可使子宫内膜停止生长，所以巧克力囊肿术后应尽早妊娠可以提高受孕几率。
手术后2个月内复查。如果你想检查卵巢囊肿，通常在月经干净后通过b超检查。与上一个结果相比，是否有渐进增长。如果典型的卵巢子宫内膜异位症囊肿可以通过病史、妇科检查结合B超诊断，但这不是金标准。其实有些卵巢子宫内膜异位囊肿的诊断比较困难，甚至需要腹腔镜诊断。
卵巢巧克力囊肿是由于子宫内膜异位到卵巢上生长而导致形成，会引起进行性的痛经，甚至是导致不孕。切除手术以后，禁止同房和盆浴一个月，以免由于过早的同房和盆浴导致引起盆腔的感染，同时还要禁止做重体力活动，饮食清淡才行。
