阴茎短小还会造成其它器官的发育，常伴有睾丸发育差，造成包皮包茎。而包皮包茎有可能会引发前列腺炎，龟头炎等一系列男性疾病。青春期阴茎发育不良的在心理上有一定的自卑和压抑感，常年累积下来的心理压力会造成性格上的压抑，又发性自卑、性冷淡等严重的身心疾病。
阴茎短小指的是阴茎的长度小于正常平均值的2点5个标准差。对于成年男性来讲，阴茎在疲软状态下小于5厘米、在牵拉长度的条件下小于7厘米、在勃起的条件下小于9厘米，则称为阴茎短小。
及时去医院进行检查看看，只要有正常的射精，精子发育正常，这是不会影响生育的，定期体检，看看身体发育情况，如果过于短小，这可以去医院手术矫正等，平时加强饮食营养，加强锻炼身体。
小阴茎可使夫妻性生活不满意，影响女性快感，严重者甚至导致婚姻破灭裂，肥胖人群，包茎短小，怕受歧视，在浴室、公厕等公共场所难免被看见，易产生自卑和焦虑情绪，年龄较大，阴茎萎缩，影响正常排尿，先天缺失、烧伤或阴茎癌术后等，给病人及其家属造成痛苦。
如果阴茎在疲软状态下可以达到4-6厘米，或者勃起状态下可以达到10-16厘米就完全属于正常。如果阴茎勃起状态下小于6厘米，考虑阴茎过于短小，会影响正常的性生活，可以考虑做阴茎延长手术。目前多采用微创手术，可以使用自体脂肪填充，让阴茎变长变粗，创伤较小，恢复起来很快。
没有药物可以使阴茎变小，但是随着年龄的增长，阴茎会逐渐变得越来越软和小。然而，如果现在用药物使阴茎变得更小更软，可能会导致阳痿和早泄，也就是说，如果使用这种药物，将会导致非常严重的情况，影响未来正常的性生活，所以这样做并不容易。
