胃蛋白酶为消化性蛋白酶，多由胃黏膜上主细胞产生。胃蛋白酶原1较低可能是因为胃粘膜有轻度或中度萎缩或胃黏膜炎症使主细胞受损而降低导致的。
通常慢性萎缩性胃炎、慢性胃扩张、慢性十二指肠炎及其他消化道疾病均可导致胃蛋白酶分泌降低，因此建议患者及时到医院行胃镜检查，明确诊断后，给予对症处理。治疗期间注意休息喝饮食。
胃蛋白酶原比例为反应胃黏膜功能状况。
胃蛋白酶原1偏低可因消化不良，胃肠功能紊乱，肠道菌群失调或胃癌，恶性贫血，胃切除，胃底黏膜受破坏等原因，均可引起胃蛋白酶原1的偏低。因此更应注意饮食规律、及时休息、注意腹部保暖等，再经过两个月左右的调整，复查时，若仍处于较低水平，宜做胃镜检查以查明原因、对症处理。
胃蛋白酶原比值偏低不一定是癌症。胃蛋白酶原检测指标能反映胃黏膜功能状态。结果偏低，有很多原因造成如饮食，药物，幽门螺旋菌感染，轻度溃疡，慢性胃炎，慢性胃扩张等，都可引起胃蛋白酶原比值偏低。
胃蛋白酶原1低是可能是萎缩性胃炎或者胃癌导致的。
胃功能四项中有胃蛋白酶原1。胃蛋白酶原较低，说明胃腺的分泌功能降低，腺体萎缩，有可能是萎缩性胃炎。主要用于检查萎缩性胃炎和胃癌，对胃镜检查有一定的参考价值。如果是有胃癌的家庭成员，或者是长期抽烟酗酒，或者是经常食用烤串、煎炸、腌制的食物，建议可以通过检查胃功能四项来判断胃部的状况。
胃腺主细胞分泌胃蛋白酶原，幽门腺和Brunner腺分泌胃蛋白酶原，经胃酸作用，胃腔内pH值下降至5.0以下，无活性的胃蛋白酶原转化为活性胃蛋白酶，pH1.8~3.5时酶活性最高，随pH值升高而降低，如果升至6以上则失活。此外，胃蛋白酶原还可通过分离小分子多肽，使胃蛋白酶自身活化。是消化系统较为重要的组成部分。
胃蛋白酶原2偏低可能是胃泌酸功能障碍、胃底胃窦的萎缩性变化等导致的。具体情况分析如下：
胃蛋白酶原2主要由胃底腺的主细胞和粘液颈细胞分泌，胃蛋白酶原2与胃窦-贲门腺、胃窦的幽门腺、十二指肠上段均可分泌。胃蛋白酶原含量较高，提示胃泌酸功能紊乱，患者同时还会出现胃底胃窦的萎缩性改变，需要及时去医院通过胃镜检查来明确诊断。
