治疗弱精少精畸形精子症除了药物治疗之外，配合一些富含锌、硒和蛋白质的综合调理，可以促进优质精子的生成，还能改善精子的生长环境。适当增加奶制品、黑豆、黑米的摄入，也需要避免吸烟，喝酒，药物治疗，可以结合中医辨证治疗。
要根据患者的具体情况来进行治疗，比如男性不育的临床表现为生理性，功能性，器质性等，我们的治疗方法主要是针对不同的病因进行针对性的治疗。如果是由于精索静脉曲张引起的，我们可以通过手术来提高精索静脉曲张。还有一些患者也会出现泌尿生殖道的感染性疾病，比如前列腺炎、精囊炎等，都会对精子的质量造成一定的影响。
对于男性不育，要结合病人的身体状况，确定其原因，进行系统的调理。
从整体上说，可以从两个角度进行治疗不孕症。一种是用药，一种是外科。药物治疗主要是通过对病人身体状况的检测来进行选择。如果病人有感染，可以使用抗生素。如果是少、弱精的病人，可以口服一些促进精子活力的药或者是生精的药。有阻塞的病人可以考虑是否要做外科手术。没有精子可以通过人工受精、体外受精等方式进行。
精子畸形率高，应先要找到畸形精子的病因，若是物理因素造成的不生育，那就应积极的消除不利因素，比如放射线、高温、烟酒一类的，还有要进行规律的性生活，注意多加休息，加强体育锻炼，少吃辛辣的食物。
一般情况下，畸形精子怀孕不是畸形。具体情况分析如下：
男性精液中存在畸形精子，正常情况下，正常情况下男性会出现这种情况，正常情况下不超过60%就可以正常怀孕，而且怀孕后胎儿不会出现畸形，因为受孕是精子快速向前活动，与卵子结合的过程。但是胎儿畸形与其他因素有关系，需要定期进行产检，比如怀孕期间服用药物导致胎儿畸形，或者服用放射性物质。
