药流不干净进行清宫，有可能会引起子宫内膜的损伤或者是宫腔粘连，但是如果不清宫，损伤是更严重的，容易引起大流血或者是宫腔里的感染，这种感染引起的宫腔粘连是更严重的，一定要权衡利弊。
清宫对身体伤害很大，虽然不是那么疼，但也相当于又一次流产，如果要是血块残留在子宫时间过长，会影响正常排卵，内分泌不调，而且毕竟是死血，会有恶臭，细菌也会趁隙繁殖，感染到卵巢输卵管，就有可能会导致不孕。
药流不干净、不进行清宫手术，很容易导致残余的胎囊组织留在子宫内，还有可能继续生长。如果药流不全、不清宫，还容易导致子宫感染，诱发各种并发症，还会损害子宫内膜，破坏胎儿着床的部位，进而引发女性发生不孕。还有可能导致女性出现大出血等现象，有可能会导致休克、贫血，甚至是危及女性的生命安全，药流如果没流干净，必须进行清宫手术。另外，还有可能会导致子宫感染，诱发子宫内膜炎、盆腔炎、附件炎等其他的炎症。
药物流产后，一般阴道流血持续的时间比较长，一定要注意保持会阴部的清洁，如果不注意卫生，可能会引发感染。药物流产的完成率只能达到90%以上，不能够保证百分之百。如果流产后，阴道流血的时间比较长，可以进一步到医院检查一下。如果有宫内残留的情况，必要的时候是需要清宫处理的。
每个人的并发症都是不一样的，可以进行手术治疗，手术时应贯彻微创理念，坚持做显微外科手术，必要时配合神经电生理监测，以做到尽可能松解栓系，避免神经损伤，减少再粘连和栓系，以及预防术后伤口并发症。
打胎药流不干净会引起长时间出血，甚至引起宫腔感染等，必须要做刮宫处理。药物流产的适用时间在怀孕的早期（从末次月经的第一天算起的39～49天之中）。在进行药物流产之前，一定要做B超检查，首先要排除宫外孕的可能；其次要测量胎囊的大小，胎囊超过2.3厘米的不适合做药物流产。
