一般来说，宝宝肠炎的治疗要按引起病因的不同，治疗方法不一样。
1.真菌性肠炎，多见于早产儿、体质虚弱的宝宝，大便表现为豆腐渣样大便，所以宝宝肠炎的治疗，要制霉菌素进行抗真菌治疗。
2.宝宝肠炎可能是饮食不洁引起的，容易被大肠杆菌感染，可以吃阿莫西林或蒙脱石散，具有抗感染、止泻等作用。
注意休息，饮食以清淡、易消化为主，尽量不吃辛辣刺激性食物
一般情况下，宝宝霉菌性肠炎，可以通过以下几种方式进行治疗。具体情况分析如下：
1.需要进行相应的辅助处理，如果是霉菌性肠炎，会导致大便的数量增加，导致体内的脱水和电解质出现问题，需要通过服用补液盐来进行补充。
2.还可以服用益生菌，比如霉菌性肠炎，主要是由肠道菌群失调所致，可以使用益生菌进行调理。
3.还可以口服氟康唑，这类药物主要用于治疗霉菌，具有一定的抑菌效果。
一般情况下，宝宝肠炎发烧，需要根据病情原因来进行治疗，具体分析如下：
肠子感染造成的炎症反应，如果体温没有高于38.5度，说明孩子的心理状况良好，可以考虑用原发性肠炎进行治疗。要针对具体的病情选用适当的抗生素进行抗感染的处理。感染得到了有效的控制，身体的温度也会恢复到正常水平，但是如果孩子的情绪很差，或是因为肠道炎引起的腹泻，出现了大量的腹泻，那么要注意调节体温及时输液，避免出现脱水和高温惊厥的情况。
肠炎的孩子首先需要判断一下是细菌感染引起的还是病毒感染造成的，如果是细菌性的肠炎，需要使用抗生素控制感染的。如果是病毒性的肠炎，对症处理就可以了。平时不要吃辛辣刺激性食物。
如果是肠炎，应该到医院检查一下大便常规和血常规，确诊后再治疗，可以选择肛门给药，之后再考虑口服，因为有时肠炎严重的话有可能造成肠道吸收不良，所以会是药物起不到应有作用，另外要多饮白水，不能使他脱水，那样就要打点滴了。
通常情况下，宝宝细菌性肠炎可以通过食物和药物来治疗。具体分析如下：
细菌性肠炎是由各种致病菌引起的一类特异性结肠炎，主要通过消化道传播，有明显的季节性，多发于夏秋季。如果宝宝细菌性肠炎，可以使用药物来治疗，例如头孢克洛颗粒、蒙脱石散、妈咪爱等。同时要注意饮食和保温，年长儿要停鱼、肉、蛋、奶、蔬菜、水果，可以吃稀点的米粥、面条、咸菜，适当多喝水。
