大部分的医院会采用激光或者冷冻的方法来治疗跖疣。这种方法属于物理治疗，见效快，但是比较容易复发。用切除的或者腐蚀的方法对跖疣的角质皮层去除，属于物理治疗，容易复发。跖疣是由人体病毒感染引起的，不建议使用创伤性的治疗方法。
脚底长跖疣可以选择使用一些冷冻或者是激光的方式去除掉，有必要可以选择使用外用的抗菌软膏进行涂抹，连续外用两个月，目的是为了防止这种疾病复发，同时有必要可以选择光动力等方式进行治疗。治疗疗效相对来说会不错的。
需要去治疗和注意一些生活细节，疣可以传染给他人，尽量与其他人分开用洗浴用品，洗脚盆之类的东西。通常比如说用电子激光来进行治疗，也可以用冷冻的方法来进行治疗，严重的话要采用全身化疗或放疗的方式来进行治疗。
跖疣多是由人类乳头瘤病毒感染引起的，可以通过皮肤的微小破损自身接种传染。并且会传染得越来越多，越来越严重，有的跖疣是寻常疣在足底挤压形成损害，是病毒感染造成皮肤赘生物，免疫力下降，会有播撒，自愈的可能非常非常低的。发现跖疣就要尽早地治疗。
跖疣的治疗方法主要有如下几类，需坚持长期治疗：
1.常用液态氮冷冻、激光烧灼、火针、中药泡洗等方式，方法很多，但是目前没有任何一个方法可以保证绝对的一次能把跖疣除根。
2.断根的方法贵在坚持治疗，发现跖疣以后一定要积极治疗，有的可能一两次做不净，一定要坚持治疗，直到把皮损完全去除。直至皮损区基本光滑，和正常的皮肤一样可见皮肤纹路。
通过坚持长期治疗，一般就能达到治愈的目的。