神经系统脱髓鞘疾病不必手术治疗，其面积广泛，无法手术干预，要口服药物治疗，定期复查头部。脱髓鞘疾病分为生理性和病理性。若是生理性则和年龄有关系，不用太在意。若是病理性的，需要找到原因，进行治疗。
如果是缺血性脱髓鞘，轻微的病变是不需要特别处理的，但如果出现了头晕、认知障碍等症状，可以口服一些改善循环、营养神经的药物，例如：胞磷胆碱钠胶囊、贝前列腺素钠片、尼麦角林胶囊、尼莫地平片、奥拉西坦胶囊、银杏叶片等。急性播散性脑脊髓炎以多发性硬化、视神经脊髓炎、急性播散性脑脊髓炎为主。炎症性脱髓鞘的治疗在急性期可以选择大剂量的激素，也可以是丙种球蛋白，在症状消失后可以口服免疫抑制剂或干扰素来维持。
一般情况下，炎性脱髓鞘可以采用以下方式及进行治疗：
炎性脱髓鞘主要由外周神经脱髓鞘及中枢脱髓鞘组组成。吉兰巴雷综合征是炎性脱髓鞘的主要病因，而多发性硬化症则是以其为主。在急性期时可以遵医嘱口服泼尼松、地塞米松等药物进行治疗。如果出现严重的情况，可以使用大剂量的甲强龙，给予短暂的冲击。还可以口服维生素B1、维生素B6、腺苷钴胺、甲基钴胺等药物进行治疗。平时注意保暖，尽量不要受凉。
脱髓鞘疾病分为炎症性脱髓鞘和缺血性脱髓鞘。炎症性脱髓鞘的治疗要针对病因，大多数需要使用糖皮质激素，其主要作用是抑制炎症反应、防止脱髓鞘进一步加重。使用营养神经的药物，促进髓鞘修复和再生。缺血性脱髓鞘要以改善微循环、活血化淤为主，营养神经的药物使用和炎症性脱髓鞘基本相同。
脑脱髓鞘又叫中枢神经系统脱髓鞘，大多数情况下都不能有效的治疗，早期可以口服波尼松、地塞米松等药物，并能促进大脑的新陈代谢，促进血液循环。脑苷肌肽，长春西汀，脑蛋白水解物，奥拉西坦，吡拉西坦等都是提高脑代谢的有效药物。常用的药物有丹参酮、维脑路通、疏血通等。脑桥中心髓鞘溶解症、同心圆性硬化、多发性硬化是脑脱髓鞘病变的主要原因。