左侧卵巢囊肿有是会影响怀孕的。卵巢是卵子发育、成熟、排出的场所，而各个不同阶段的卵泡在卵巢皮质，若卵巢遭受到破坏，使卵子发育，成熟及排出受损，就会导致不孕。所以若患有卵巢囊肿应该先治疗在生育，以防万一。
怀孕时查出左卵巢囊肿可能是孕激素水平升高引起的，可以不做处理。需根据孕妇的实际情况进行判断。
如果是在孕期发现了左边的卵巢囊肿，那么要看其大小和类型。不管是左边的囊肿，右边的囊肿，如果是怀孕后才有的，则可能是生理性的卵巢囊肿。这是因为孕妇在孕期期间，雌性荷尔蒙和黄体酮的含量会出现波动。这种囊肿通常都是很小的，不会长到3厘米。当卵巢囊肿大于5厘米时，会对周边的脏器造成压力。如果是因为小肠或者是子宫受到了挤压，会对孩子的生长造成一定的影响，则可能需要进行手术。
左卵巢囊肿怀孕是会消失的，在孕早期检查出了卵巢囊肿以及盆腔积液现象，但是如果没有明显的症状，并不需要特别的治疗的，要清楚孕育生命对于囊肿也好积液也好，都是一种治疗手段，这些因素，是不会影响到胎儿正常的发育的。
如果在怀孕之前或之后没有发现卵巢囊肿，则左侧卵巢囊肿在怀孕三个月后出现。这可能是由于怀孕期间体内的激素水平。目前，卵巢囊肿的大小应首先确定。如果囊肿非常小，不能治疗，可以进行定期检查。如果囊肿很大，就可能导致流产。有必要结合自己的临床诊断，看看是否需要继续妊娠。
卵巢囊肿会直接影响到卵巢功能，对于正常生育是会存在一定影响的，对于卵巢囊肿治疗通常是需要考虑手术治疗。只要术后卵巢功能恢复正常，那么就可以恢复正常的生育功能的。
卵巢囊肿会影响怀孕的，而且容易发生流产。留院观察，以免造成早产的后果。由于卵巢囊肿对胎儿有很大的影响，因此一定要早点接受手术。通常在怀孕后发现卵巢肿瘤一般选择妊娠16周左右施行手术。