通常对于囊肿的治疗来说，首先要彻底分清区分囊肿是属于良性还是恶性的。如果囊肿是良性的，没有必要担心了，可以通过口服一些中药进行保守治疗慢慢调养。但如果囊肿是恶性的话建议要尽早采用手术的治疗方式进行治疗，如果手术治疗方式效果不佳的话，还可以再生全身化疗的方式，这些方法就可以彻底治疗囊肿。如肾脏囊肿，若是4cm以上的肾脏囊肿，可以通过腹腔镜手术就可以治疗；4cm以下的肾脏囊肿，也可以通过B超定位下穿刺进行治疗。
通常囊肿小于5厘米是无症状的，所以没有必要治疗。只需要定期的超声波检查来观察它的变化。大于5cm的囊肿可能出现并发症，如肝囊肿引起的胆管扩张、继发性高血压或肾囊肿压迫肾动脉或肾盂引起的肾积水，肝、肾表面的大囊肿甚至有破裂的危险。
常见的肛周囊肿有这三种，骨盆直肠窝脓肿又称骨盆直肠间隙脓肿，较为少见，但很重要。直肠后间隙脓肿属于肛提肌以上深部脓肿，坐骨直肠窝脓肿。治疗措施：少数肛周脓肿用抗生素，热水坐浴及局部理疗等可以消散，但多数需要手术治疗，手术有两种方式。
这个部位的囊肿主要会出现腰骶部疼痛，在早期囊肿比较小，也有可能是没有症状，一般药物只能是缓解，但是完全根据这个要到医院通过手术，尤其是输卵管的检查，如果有输卵管慢性炎症或是粘连堵塞等问题，要及时进行治疗，避免再次发生宫外孕。
在发病之后还是可以进行体育锻炼的，而宫颈囊肿是慢性宫颈炎的表现，囊肿一般生长很缓慢，活动和囊肿的生长是无关的。在康复期间都可以根据身体的体质状况，适当的增加一些体育锻炼，常见的有：做健身操、散步、太极拳等。通过体育锻炼可增加食欲，提高身体抵抗力，增强体质，以达到治好宫颈囊肿，加快身体康复的目的。
