精子畸形99是不可以自然怀孕的。因为这时候男性的受孕机率很低，具体是什么原因引起的，需要进一步的检查。首先要考虑是男性不良的生活习惯，比如长期熬夜，精神压力过大，抽烟喝酒，泡温泉，蒸桑拿等，这些因素都会导致精子畸形或者死亡。
精子畸形考虑是由于生殖器官的炎症，精索静脉曲张，睾丸发育异常或者体内存在有精子抗体，内分泌失调，缺乏微量元素等。可以去三甲医院泌尿外科做泌尿系统的彩超，前列腺液常规以及精子抗体的检查，性激素六项以及染色体检查看看是什么原因导致的，以便对症的治疗。如果是因为染色体异常导致的精子畸形，治疗效果比较差，大部分可以考虑做试管婴儿。
精子活力20%通常能生育，但难度相对较高。
能否能够怀孕与夫妻双方身体状况、性交时间、精子质量、排卵时机等多方面有关。而精子的活力，也就是所谓的精子运动能力。如果精子活力20%，考虑为弱精症，此时通常存在受孕的可能性，但怀孕的几率肯定要小，并不意味着完全不能生育。建议男方到医院进行检查，明确引起精子活力低下的原因，再进行针对性治疗。
一般情况下，精子畸形率98%能生育，但是生育的几率较低。具体情况分析如下：
男性不育症的常见原因是精子畸形率高。98%的畸形率超过了严格的生育力评估标准（标准为96%）。也就是说，这种畸形率会严重影响到正常生育，但也不是绝对不能生育，只是降低了生育几率而已。精液质量不仅要看畸形率，还要看精子密度、精子活力等各项指标。
精子畸形率高，应该检查引起精子畸形的原因，根据病因进行系统的治疗，只要有信心就能完全治疗，期间可以口服点药物，平时养成规律的生活习惯，不要经常熬夜，远离各种辐射环境，这样可以防止畸形精子的发生。平时要注意休息，多喝热水。
