小孩衣原体感染，表现为尿频、尿不尽、尿黄、尿道口微红、尿道痛、尿滴沥、烧灼感，还有排尿不畅的现象，甚至还会出现腰酸、下腹部隐痛、会阴部不适，还会出现肛门不适、阴囊潮湿、性功能减退、前列腺液等多种症状，部分还会引起发热、咳嗽、精神差等呼吸道症状；在生活中，家长应该注意孩子的保暖，多让孩子喝水，饮食一定要清淡，避免辛辣、刺激、上火的食物。
小儿肺部衣原体感染多不发热或低热随后出现咳嗽，且日渐加重。出现百日咳样阵咳，但无回声，呼吸增快为典型症状，偶有呼吸暂停，肺部可出现湿啰音，有时可有呼气性喘鸣音可伴心肌炎、胸膜炎、胸腔积液。
感染不同的部位，症状是不同的。发烧，鼻塞流清涕，伴有咳嗽，应该是支原体感染出现的气管感染，如果咳嗽咳痰增多，呼吸困难，喘促，应该是肺感染现象，衣原体感染可根据药敏试验选用敏感的抗生素对症抗感染治疗，引起发烧需要及时地降温治疗，有物理降温以及药物降温等方式。
小儿支原体感染后的主要症状有发热、咳嗽等。发热一般呈中度和高度发热，个别也会有持续的低热，且发热时间比较长。咳嗽一般呈阵发性的咳嗽，初期为刺激性咳嗽，咳嗽起来比较严重，有类似百日咳样的咳嗽。
男性衣原体感染的症状通常有尿道发痒、尿频等。
衣原体是一种能引起尿道炎的病菌，这种病可以通过性接触传播，男性出现衣原体感染后会出现尿道发痒、尿道刺痛、尿道灼热等症状。尿道口分泌物多为白色稀薄分泌物，尿道滴白。男性一般需要做中段尿培养或者尿道分泌物培养，通过选择有效的抗生素，一般能有效地缓解不适。
妇科衣原体感染有白带异常、阴道流血等症状。
1、白带异常：女性生殖系统感染衣原体后，炎症刺激会使白带的分泌增加，并且会有异味。病情较重的患者可有脓性分泌物、粘液或浆液分泌物等。
2.阴道流血：衣原体感染后，宫颈粘膜会出现充血、水肿，尤其在同房的时候，经常会因为反复的摩擦而出现局部溃破、出血。
