肺功能衰竭可以到内科进行治疗，要改善患者换气和肺通气功能，来治疗患者的其他疾病，寻找病原体并且积极治疗，可以使用敏感抗生素来保持呼吸通畅和患者的通气量，也可以使用肾上腺皮质激素进行输液。如果效果不明显，可以使用呼吸机。肺功能衰竭会产生缺氧的状态，患者不会自主排痰，家属可以帮患者翻身、拍痰，要加强患者身体营养，增强抵抗力，避免给身体其他器官衰竭，肺功能衰竭，以救治为主。
不能单纯的比较慢阻肺与肺气肿病情的严重程度，慢阻肺不是一个疾病，是一组以气流不可逆的、受限为特征，包括慢性支气管炎所产生的，肺气肿其实不是一个疾病，是一种病理的状态，很多疾病都可以存在肺气肿，比如慢阻肺，可以存在肺气肿、支气管哮喘、支气管扩张、肺结核，还有其它的肺炎，也可以产生肺气肿。
肺气肿是由于支气管末端的弹性组织出现膨胀和充气，引起肺部容量增大，出现肺泡和支气管破裂形成的病变。出现这种疾病，气道不一定会受到影响，例如，老年性肺气肿，间质性肺气肿。只有出现阻塞性肺气肿才叫慢性阻塞性肺疾病。有气道和气流受到限制，才可以诊断为慢性阻塞性肺疾病，两者有很大的区别，慢性阻塞性肺疾病会导致呼吸衰竭，但是肺气肿并没有气道受阻的现象，患者没有呼吸困难和衰竭的症状。
慢阻肺和肺气肿的主要区别是慢阻肺属于呼吸道疾病，患者主要会表现为呼吸困难和胸闷气促。而肺气肿属于病理诊断，是患者的肺泡出现了结构异常性扩大，从而表现出来的病理诊断。慢阻肺患者需要在专业医生的指导下采用抗炎平喘的方式进行治疗，当患者出现合并细菌感染的时候，会出现咳嗽咳黄浓痰以及发烧的症状，这时需要进行痰培养。
大多数肺衰竭患者是由于呼吸困难和肺功能减退引起的缺氧所致，有些病人甚至患有组织水肿，这类患者死亡前的主要表现是血液营养素饱和度低，有时，呼吸缓慢下降，嘴唇变紫，甚至出现身体水肿。
肺功能衰竭经有效治疗部分患者是可以完全恢复的。肺功能衰竭治疗主要是控制原发病和基础疾病，患者日常必须戒烟限酒，如果身体确实虚弱，可以做一些简单的活动，只要适合自己身体状况的即可。