轻微口腔扁平苔藓能自愈，但是自愈的病患很少，是因为口腔扁平苔藓病因及发病机制到现在尚不明确。要避免口腔接触任何刺激性食物，尤其要注意有医治效果的牙膏如果有刺激感，也不能用。
治疗时间一般在三年左右，口腔苔藓的发生主要和精神状态压力过大，内分泌功能紊乱有关，对于扁平红苔藓需要及时的应用激素类药物进行治疗，如果不得不到及时的治疗，有可能会发生癌症变的危险。可以吃口服药来改善缓解症状，在平常的时候养成良好的饮食卫生习惯，多吃蔬菜水果，不要吃口味较辣刺激的食物。
口腔扁平苔藓癌变率大概在1%左右。口腔扁平苔藓是一种慢性黏膜炎症，发病的原因是不确定的，认为和精神因素如疲劳、焦虑、紧张等有关。也可能和免疫系统功能障碍，免疫力低下有关，内分泌失调也有可能诱发此病。遗传因素也是原因之一，如果家庭成员中有口腔扁平苔藓，那么患病的机会就会增多。另外，个人口腔卫生差，细菌感染机会增多，也容易诱发此病。
扁平苔藓可以通过电子显微镜和病理切片发现可疑的病毒和细菌，一般高黏血症与再生循环障碍与扁平苔藓有很大的关系，平时要注意保持愉悦的身心，不要有太大的压力，生活作息要规律，可考虑中西医结合治疗。
扁平苔藓是一种不明原因引起的累及皮肤、毛囊、甲、黏膜的慢性炎症性疾病，治疗扁平苔藓要到专业的口腔黏膜科，治疗扁平苔藓要利用自身免疫系统与本病的密切关系，且各脏腑经络病变的相互传变，对扁平苔藓进行辩证论治。采用中西医结合免疫平衡治疗体系，将中医中药治疗跟口腔治疗仪物理治疗相结合，有效治疗扁平苔藓积极的治疗是可以治的，不必担心。
药物可以深入甲板和皮肤层，杀死寄生在甲板角质和周围皮肤中的真菌。整体治疗可由稀有中草药制成。煮沸后，浸泡或外用。还有一个偏方。弄湿后，试着把药物涂在患处。一些其他的药物也有治疗效果。
