儿童先天性肾病综合症（先天性肾病综合症）相对预后较差，但极少有肾功能衰竭发生，大多数病例狐仙感染较重，营养不良，腹泻和水电解质紊乱等症状较多，其治疗方法以对症支持治疗为主。
需缓解水肿、限制食盐、利尿剂如速尿等。需给以高热量充足蛋白质，同样在感染发生时需控制感染，可选用头孢或阿莫西林等。用血管紧张素转化酶抑制剂（如卡托普利）能显著缓解蛋白尿。
小儿麻痹症患儿在疾病的早期，肌肉发生萎缩和肢体瘫痪，但瘫痪的肢体并无畸形。随着病程的延长，才慢慢出现各种畸形。病人多有关节畸形甚或骨盆倾斜、脊柱侧弯等继发性病理改变，这给医生在确定手术适应证时带来困难。
小儿自闭症通常是先天的。
小儿自闭症是一组遗传因素和环境因素共同作用所致的疾病。患儿在社交方面存在缺陷，表现为回避目光、对呼唤缺少反应等。目前自闭症的研究可能跟某些基因有关，所以有一定的遗传倾向，但是如果后天缺乏父母的关爱，父母和孩子之间缺乏沟通，就会导致自闭。主要表现为不合群，脾气暴躁，不听大人的话，喜欢看动画片，智力发育迟缓，不能参加集体活动。
小儿疝气可能是先天的。
儿童疝气分为先天性和后天性两种，一般是先天性的，因为先天性的解剖学上的问题，在胎儿的初期，睾丸在腹膜后二至三个腰椎间盘，然后慢慢向下，在腹股沟的深处，在腹股沟的深处，会带动腹股沟，腹部的肌肉通过腹股沟的管道向下移动，从而产生一个阴袋，随后腹膜向下移动，形成一个鞘状的突起，然后是一个包裹着睾丸的鞘状突起，然后是一个紧靠着后面的脊索，这个过程叫做“固有的”。剩余的则是自然的收缩和封闭，只留下一条纤维索。如果没有完全封闭或者是没有形成完整的，那么就是先天性的斜疝。
肝移植是先天性胆道闭锁发展至终末期惟一有效的治疗手段。在小儿（年龄小于18岁）肝移植中，先天性胆道闭锁所占比例接近一半，其中1岁以内中，所占比例约90%。葛西手术后约67%的儿童在成人之前仍需要肝移植救治，由此，葛西手术成为了病人在接受肝移植以前的一种过渡性治疗。通常，病人接受肝移植手术时机被认为是葛西手术术后胆红素持续在10mg/dl以上和年龄120天以上肝脏已出现明显硬化。
小儿良性先天性肌弛缓综合征的治疗方法有药物治疗、运动训练、被动按摩等。
1、药物治疗：常用药物有盐酸金刚烷胺片、维生素D滴剂等。
2.运动训练：适量的运动可以改善患儿的病情，提高机体免疫力，增加对疾病的抵抗能力。同时可以提高患儿的肌肉力量，训练患儿关节灵活性。
3.被动按摩：可以提高患儿的肌张力。主要按摩颈部、背部，缓解肌肉疲劳。
