一般情况下，卵巢囊肿通常不是子宫内膜异位。具体分析如下：
卵巢囊肿包括生理性囊肿，还有卵巢巧克力囊肿、畸胎瘤、黄素囊肿等病理性的囊肿。只有卵巢巧克力囊肿是由子宫内膜异位所造成的，它会伴随着女性来月经的次数而逐渐增大。因此卵巢囊肿通常不是子宫内膜异位。患者出现不适症状，应该及时就医检查，根据检查结果对症治疗。
主要症状：下腹不适感，腹围增粗腹内肿物，腹痛，月经紊乱，压迫症状。若在妊娠3个月内发现患有卵巢囊肿，进行处理时容易引起流产，如果妊娠期间发现患有双侧卵巢囊肿，在手术处理中若触动子宫。
一般情况下，左侧卵巢囊肿是否会不孕需根据实际情况来判断，具体内容如下：
彩超显示有卵巢囊肿是左边的，要看囊肿的大小和类型。女性在女性体内排卵后，左侧卵巢囊肿低于三公分，一般不会对妊娠造成什么不良反应。如果是左边的卵巢有不规则的回音，或是出现了分格，又或是进行性的痛经，那么就需要怀疑是巧克力囊肿的表现。
一侧卵巢囊肿通常不会不孕。
女性生殖器官的肿瘤是卵巢囊肿，与生活不规律、经常性熬夜、内分泌紊乱等原因引起的，但是并不会对女性的生理周期和排卵造成一定的负面影响。需要注意的是，在怀孕期间出现了卵巢囊肿，需要在主治医师的指导下进行治疗，等病情完全稳定之后才能生育，可以口服药物联合微波局部理疗，也可以考虑外科手术，否则怀孕时囊肿会变得越来越大，从而导致怀孕。
B超显像检查目前B超显象是辅助诊断内异症的有效方法。主要用以观察卵巢内膜异位囊肿，其声像图的特征为：最常见的图像是囊性肿块，边界欠清，内有稀疏光点，囊液稠厚、有时因陈旧性血块浓缩机化而出现密集、粗光点图像，是混合性肿块。肿块常位于子宫后侧，可见囊肿子宫伴随症即囊肿图像和子宫图像有不同程度的重叠。
年轻，有生育要求者一般选用保守性手术，只切除病灶，保留子宫及附件(尽量保留双侧)。对于一些无生育要求，病灶严重，且年龄在45岁以下的女性朋友，可以选择半治疗手术，尽可能保留一侧正常的卵巢组织，而全切子宫和病灶，术后复发率低，后遗症少。