临床主要选择抗厌氧菌药物。尽量避免阴道内使用腐蚀性药物，并停止使用阴道避孕用具。要注意个人卫生，经常清洗外阴，消除患病的诱因，改善全身情况。阴道有损伤时，应尽早进行阴道修补，消除阴道内异物。
用中药治疗可以彻底清除湿热邪气，消散经脉郁结，补气养血，平补阴阳，从而达到气血双盛，标本兼治，快速清除子宫内膜及阴道残留的有毒物质，清除真菌病毒感染源，使女性生殖器官内全面清洁环保，从而达到彻底治疗细菌性阴道炎的目的。改变阴道的酸碱度，可以用碱性药物冲洗阴道，以改变霉菌的生活环境。
如果平时比较爱干净，每天晚上都要冲洗一下阴道，这样就造成阴道内环境破坏，菌群失调，就发生细菌性阴道炎了。任何导致阴道微生态环境失衡的因素都可能引起阴道炎，如长期使用抗菌药、不洁性生活、滥用洗剂等。
细菌性阴道炎的治疗可以用洗液清洗外阴，缓解瘙痒和有异味的表现，同时可以服用妇科消炎的药物，预防感染和治疗炎症，改善阴道内环境的保护菌，同时加强营养加强锻炼注意休息避免疲劳熬夜可以增强自身体质。
细菌性阴道炎治疗建议中草药治疗。细菌性阴道炎治疗要使用具有清热解毒，杀虫止痒作用的中药煎水，熏洗外阴，既可以减轻症状，又能抑制消灭念珠菌。由于熏洗后病人的外阴痒痛，灼热症状明显减轻，因此更适用于急性细菌性阴道炎的妇女，可以减轻病人痛苦。另外，将中草药制成散剂或栓剂，还可以进行阴道上药。
细菌性阴道炎，可以口服药物一周，阴道上药一周，禁止同房，一般一周后可以只好的，注意保持会阴部清洁卫生干燥，内裤要穿棉质舒适的。极少数出现下腹疼痛性交困难及排尿异常感。阴道粘膜上皮在发病时无明显充血表现。在治疗期间是需要禁止有性生活的。
