药物流产不彻底做清宫术会有一定的痛苦。药物流产没有彻底清除，做清宫手术的时候，每个人的痛苦都不一样，药物流产后，服用药物后，宫颈口会有很大的膨胀，扩张宫颈不会有任何的痛苦，但是如果是负压的话，用刮匙刮宫的时候，会有一些痛苦。
如果想要减少痛苦，可以采用无痛清宫术，因为无痛清宫术是在病人昏迷状态下进行的。
现在进行药物流产，出现流产不全的情况，需要清宫手术，清宫手术的费用也是在200元左右的。有的医院药流清宫手术不收费，费用是包含在药流手术费用内。药流是人工流产的一种方法，是意外怀孕的补救措施，适合停经在49天内的早孕。药流的副作用包括流产失败，流产大出血，流产不全，需要再次进行清宫手术，药流没有干净清宫手术一般费用大概在200元左右。
一般来说，药流没干净清宫后要休息一周。
药物流产后出现药流不全，应立即进行清宫，清宫后至少要休息一个星期。药物流产后，体内的血液会流失，如果再做清宫，会对身体造成更大的伤害。如果是体质较弱的女性，会出现头晕、乏力等症状。因此，需要在床上躺上至少两周，如果还没有完全康复，可以适当的多休息。恢复期间注意饮食健康喝局部卫生。
药流后不干净是有阴道流血不停止，但是有的药流，孕囊未与子宫壁分离，虽然未流净，但也不会引起阴道流血，做一下清宫术，现在有无痛方法，是不会感觉到疼的，如果未干净却又不做清宫，对是有害无利的。
就算是药流也最好去医院在医生指导下服用不要拿自己的身体开玩笑。再说了药流所需时间较长，一般需要3－5天，并且容易发生药流不全导致大出血的现象，从而要行第二次清宫术。
无痛流产是从怀孕40天到60天之间，药物流产是怀孕39天到49天之间。无痛流产和药物流产各有利弊药物流产对子宫内膜的损伤要小一些，弊处就是容易有不全流产。无痛流产的优点是，清宫完全，不用担心，流产不全的情况。弊端就是对子宫内膜的损伤。