胚胎停育自然排出不了。胚胎停育后，三周内必须流掉。如果三周内不流掉，那就叫稽留流产，稽留流产有可能会导致蜕膜机化，不容易从子宫壁分离，以及会导致女性的凝血功能出现异常，流产时也会产生大出血及感染的发生。所以在确定胚胎停育后，应当尽量的早流掉，以免导致宫腔内感染，子宫内膜炎、盆腔炎的发生，严重者会导致影响下次怀孕甚至发生不育的现象。
胚胎停育应该及时清宫处理，不然很容易引起大出血或者是感染。在人流术后一个月之内禁止同房及盆腔坐浴，半个月不做重体力。多进食营养丰富易消化食物，多吃新鲜的水果蔬菜，增强体质提高自身免疫力。
胚胎停育女性要检查的内容有：妇科检查：外阴、阴道、子宫颈、子宫体、附件；特殊检查：白带常规、宫颈细胞学检查、B超、阴道镜、乳腺扫描、RPR、淋病、乙肝、甲肝、肝功能、HIV；胎儿畸形：CMV、RU、TOX、单纯疱疹病毒、染色体；内外科：心电图、胸透、血型、血糖、血分析、尿分析；。
早期胚胎停育原是由于胚胎染色体异常。当存在胚胎停育的主要危险因素，包括胎儿父母的年龄较大，孕妇子宫畸形，盆腔感染与免疫病，弱危险因素包括既往自然流产史，不孕及辅助生殖，孕期药物使用，孕期咖啡因/吸烟/酒精暴露，肥胖，甲状腺功能不全等可能发生。
避免胚胎停育在排卵前要减少性生活并做好孕前准备—体质、心理、环境等准备。对胎停育的预防中医中药调治很重要。不能因为西医检查正常就不予重视、理会、治疗，而发生再次胚胎停育的不良结果。所以，孕前必要的基础调治及孕后安胎养胎调理是必要的。
