要根据不同的疾病，选择不同的检查方式。常见的泌尿系统感染、结石，需要查尿常规、血常规、泌尿系彩超。泌尿系肿瘤需要进行泌尿系影像学检查，以及相关的肿瘤标记物检查。
泌尿系统检查包括体格检查和实验室检查。体格检查主要检查肾脏，输尿管，膀胱，阴茎，尿道口，阴囊及其内容物，直肠和前列腺等，实验室检查主要包括尿常规检查，肾功能检查，血清前列腺特异性抗原检查，前列腺液检查，精液检查等。
主要有尿常规、泌尿系统彩超。另外，进一步检查还可以做泌尿系统CT、核磁等检查，泌尿系统的侵入性检查，常见膀胱镜检查、输尿管软镜检查、肾脏穿刺活检、前列腺穿刺活检以及经直肠的超声检查等项目。
泌尿系统由肾脏、输尿管、膀胱、尿道及有关的血管、神经组成。主要功能是生成和排泄尿液。其常规检查有尿液常规检查。细菌培养和菌落计数。尿生化检查。影像学检查包括超声为泌尿系统检查首选项目。尿路平片和静脉尿路造影。膀胱或尿道造影。CT或磁共振水成像。
脱肛应该先检查肛门视诊：可发现排粪时有柔软团块状肠粘膜脱出肛外，排粪动作时见肠粘膜自肛门脱出。直肠指检：是医生用一个手指头伸进肛门，是检查疾病的一种简便易行却非常重要的临床检查方法。
泌尿系统彩超检查主要是检查双肾、输尿管和膀胱。检查肾脏的时候，要观察双肾的大小、形态是否正常，包膜是否光滑，肾内的结构是否清晰，再用彩色多普勒检测肾内的血管显示是否清晰。
