常规的治疗方法包括，抗脑水肿，神经营养，预防和纠正水、电解质紊乱。早期实施气管切开，恢复期可用高压氧舱治疗等，严重的要手术治疗，能否留下后遗症要根据出血量的多少，具体部位，脑组织受损的程度，时间长短，个人体质（自我修复的能力），以及治疗的情况等而定。
脑出血以保守治疗的方式为主。脑干出血如果相对症状比较轻微，仅仅有头痛、恶心、呕吐的症状，并且出血量相对较小，没有产生明显的其他伴随症状，可以通过药物的方式进行治疗，大量的脑干出血，从而形成了脑疝，甚至产生了呼吸、心跳等节律的改变，如果血肿量较多，可以进行外科手术。
治疗的方法有，发病后4.5小时之内到达医院，确定诊断后可以应用静脉溶栓治疗，给予尿激酶100单位至150单位，静脉溶栓治疗。如果超过4.5小时，在6小时之内可以启动动脉溶栓进行治疗。经股动脉穿刺，将动脉导管放置在脑干血管堵塞处，给予尿激酶溶栓治疗是积极的治疗方法，在溶栓治疗后24小时或者不适合溶栓的病人，应该启动抗血小板治疗。
一般情况下，脑干堵塞是否治好，需要根据实际情况判断，具体分析如下：
脑干是人的中枢神经，如果出现梗阻，不能及时进行急救，可能会出现呼吸紊乱等情况，必须及时采取有效的溶栓措施，大部分患者都能痊愈。但如果梗阻的位置比较大，且病情持续时间比较久，如果不及时进行消融处理，那么，根治的希望就渺茫了。
需要注意的是，平时要注意避免过度劳累，不要进行重体力劳动或者剧烈运动，饮食以清淡为主，有利于身体健康。
脑干梗死能活多久，没有具体的时间，因为同样是脑干梗死，病情轻重是不一样的，轻微的一些并不影响到寿命，可以长期生存，不会因为梗死而导致出现死亡。而严重的脑干梗塞会直接影响到呼吸和循环中枢，这样会在短时间内危及到生命，所以这病情差异是很大的，无法一概而论。
原发性脑于损伤在颅脑损伤中占有较大的比重，通常指暴力作用于枕部引起脑干为主的损伤，并于伤后立即发生持续时间较长的意识丧失或死亡。暴力作用于头部造成的原发性脑干损伤约占颅脑损伤的2%~5%，在重型颅脑损伤中占10%--20%。脑干内除了颅神经核。
