新生儿在出生后要打的是卡介苗和乙型肝炎，在生后三日就要进行皮下注射。
如有皮肤的病变、发烧等早产儿，可以暂时停止使用卡介苗，因为有可能存在先天免疫障碍的婴儿不能打卡介苗，以免引起身体的全面感染。在出生24小时以内注射乙型肝炎，第二、三次注射分别为1-6个月。如果母亲是乙肝病毒携带者，那么孩子出生后6个小时内要注射100个单位的高质量的乙肝免疫球蛋白，还要打乙肝疫苗。
乙肝疫苗注射的第一针是在小孩出生当天，即小孩分娩出来后的24小时内，越早注射越好，第二针在出生后的第二个月，然后第六个月注射第三针，这是正常注射乙肝疫苗的方法。另外现在为了减少母婴传播的概率，还要打乙肝高效价免疫球蛋白，共打两针，出生当天和出生后的第二个月各打一针。
乙肝疫苗是提纯的乙肝表面抗原，为是死疫苗，接种后，可刺激免疫系统产生保护性抗体，抗体存在于人的体液中，乙肝病毒一旦出现，抗体会立即作用，将其清除，阻止感染，并且不会伤害到肝脏，从而使人体具有预防乙肝的免疫力，以达到预防乙肝感染的目的。
母亲有乙肝的情况一般在怀孕期间会有病毒阻断治疗，分娩后有注射疫苗有抗体产生的情况，如果小孩儿已经有保护性抗体了就可以母乳。需要定期检查。必要的时候是需要积极的进行抗病毒的治疗，宝宝在出生之后12个小时之内需要注射乙肝免疫球蛋白以及乙肝疫苗的，同时要密切的观察宝宝的肝功能。
需要打两针，出生24小时要接种免疫球蛋白和乙肝疫苗，一个月后接种第二针乙肝疫苗和第二针免疫球蛋白。容易感染乙肝病毒的人，密切接触的乙肝病毒的人，免疫力低下的人都可以接种免疫球蛋白，可以接种第二针乙肝免疫球蛋白，用来预防乙肝病毒感染。
乙肝疫苗的作用是让孩子体内产生抗乙肝病毒抗体，从而达到预防乙肝的目的。减毒活疫苗指的是病原体经过处理以后结构发生了改变，毒性明显的减少，但是活性保持不变，保持了原有的抗原性的一种疫苗。注射到人体当中以后不会引起疾病的发生，但是病原体可以引起机体的免疫反应，刺激机体产生免疫应答，而起到长期或者是终生保护性的作用。
