巧克力囊肿的复发几率还是非常高的。在临床上，如果巧克力囊肿的病人术后没有给予相应的干预，绝大多数都会出现复发的情况。主要是因为巧克力囊肿由具有活性的子宫内膜细胞种植在卵巢，才引起的这种囊肿，手术很难把这种活性细胞完全根除掉，所以就会复发。
卵巢巧克力囊肿指标有子宫直肠陷窝，可触及大小不等的不规则的结节状突起，触痛明显，子宫骶骨韧带增厚压痛。异位卵巢时常可触及一侧或两侧盆腔内有固定的囊性肿块，伴或不伴压痛。
复发几率不大。巧克力囊肿术后人的对侧卵巢或同侧卵巢可能有新的病灶，医生又要开始重新用药，甚至有可能要面临再次手术。如果这种病人做过2-3次的手术以后，卵巢体积就会缩小，也就预示着卵巢功能会下降，将来有可能面临早绝经，或者卵巢的抗缪勒氏管激素会下降，卵巢的储备功能下降。
年轻的女性在还没有结婚的年龄就会发现有巧克力囊肿。做了手术1-2年以后，病人的对侧卵巢或同侧卵巢可能有新的病灶，医生又要开始重新用药，要面临再次手术。如果这种病人做过2-3次的手术以后，卵巢体积就会缩小，也就预示着卵巢功能会下降，将来有可能面临早绝经，或者卵巢的抗缪勒氏管激素会下降，卵巢的储备功能下降。
卵巢巧克力囊肿早期症状表现有性变疼痛：这也是一个明显的信号，可能还伴有点状流血。不正常的经痛：痛经是子宫内膜异位最明显的症状，却是最容易忽略的先兆。没有采取避孕措施也不会怀孕。
卵巢囊肿通过一些保护性手术治疗，复发率较高的。要按时复查，不要过于担心，放松心情，平时多吃豆制品，注意个人卫生，积极配合治疗，改善生活伙食，多运动，多参加社会实践活动。
