孩子在午夜发烧40℃的时候需要进行降温治疗。突然的高热，目前尚无确切原因，可以通过物理降温，比如多喝热水发汗，或者用冰棍夹住腋下或冰敷来降温。对于年纪较大的孩子，可以用酒精擦拭腋下、腘窝和双手。对于年轻的孩子，可以用温水来擦拭身体。如果没有明显的效果，可以服用1-2次的退烧药，间隔时间为6个小时。如果出现持续高热的情况，可以到医院做进一步的检查。
引起发热的病因非常的多，发烧只是症状，而不是疾病，各种疾病都可以引起发热，比如呼吸系统疾病，消化系统疾病，血液系统疾病，风湿免疫类疾病，传染病等。建议及时就诊于发热门诊，进行病因的检查，找到病因后及时治疗，可以物理降温，比如用温毛巾擦孩子的腋窝，大腿跟，脖子下边。
通常情况下，半夜宝宝发高烧，家长可以通过使用药物、物理降温等方式进行治疗。具体情况分析如下：
1.使用药物：半夜宝宝发高烧，家长可以按照医嘱给宝宝使用小儿双金清热口服液、小儿柴桂退热颗粒、清开灵颗粒等药物进行治疗。
2.物理降温：半夜宝宝发高烧，家长可以通过用温水打湿毛巾后，擦拭宝宝的额头、颈部、腋窝等部位，可以起到物理降温的作用。
小儿如果出现体温持续在39摄氏度以上而不退热，在没做血常规检查的考虑有病毒感染或者是病毒细菌感染。家长在给孩子使用退热药的同时，需要配合使用抗病毒药物和消炎药，因为退热药只是针对发热症状，治标不治本。最安全有效的方法是家长尽快待孩子到医院就诊，查血常规等相关辅助检查，根据检查结果尽快对症用药治疗。
一般有遗传易感体质的年幼儿多见，因为中枢神经系统发育不完善，在感染发热时大脑神经元的突然异常放电，导致突然发作全身性或局限性强直性和阵挛性抽搐，一般伴有意识障碍。
