长效避孕药一般会引起恶心呕吐，不规则阴道流血，头晕，可能导致内分泌紊乱，月经不调，闭经，不孕，或者肠胃不适，头痛，体重增加，神经紧张，情绪低潮，皮肤色斑和粉刺等。每个人的身体素质不同，对药物的吸收能力也不同，所以出现的不良反应也不相同。
一般情况下，服用短期避孕药物会导致女性出现月经失调、内分泌失调、恶心呕吐等不良反应。女性内分泌紊乱会导致面部出现青春痘、胸部胀痛，还会导致闭经等症状，女性不宜长期口服避孕药，对人体有很大的伤害，可以采取安全套、避孕环等避孕措施，避孕药是不能频繁使用的，多吃一次也没有什么副作用，特别是应急避孕药。口服避孕药后会有一些症状，可以在停药后自行痊愈，停药后还没有好转，要到医院做血液检测，做激素六项的检测，要考虑是内分泌紊乱造成的，可以在医师的指导下口服一些激素类的药物，多饮水促进药物的排泄。
短效避孕药有副作用，但是比较轻微。
短效避孕药在临床上除了用于避孕以外，还常常用它进行调经。其副作用主要表现为恶心、呕吐、胸胀，以及可能会导致阴道不规则出血等情况，但是随着服用时间的延长，这些副作用都会逐渐消失。肥胖的患者要慎用短效避孕药，因为短效避孕药有可能会增加患者血栓形成的风险。在服用短效避孕药期间，一定要按照要求按时服药，不能随意漏服，以免降低避孕效果，并且还有可能会导致阴道不规则的流血。
通常情况下，在长效避孕药和短效避孕药当中，建议患者选用短效避孕药。因为长效避孕药通常剂量比较大，所以副作用也比较大一以次使用一般可以帮助避孕1个月左右。但是短效口服避孕药主要是通过抑制排卵来调节月经。虽然也会出现类早孕反应，但是一般坚持服药，症状会自然消失。而且短效口服避孕药，如果正确使用避孕，有效率相对较高，而长效避孕药避孕失败率也相对较好。
避孕药主要用于抑制排卵，具有抗卵子植入的作用。其优点是高效、长效，不需要每天服药，使用和分发方便，不影响性生活。然而，副作用也很明显。一些女性再次服用长效避孕药后，正常月经会增加，经期会延长。长期服用也可能导致闭经。长效避孕药和激素避孕药之间的相互作用会导致出血或避孕失败，应予以高度重视。
这种药物的副作用表现为有头晕、头痛、失眠、乏力。有些还会出现直立性的低血压，会出现焦虑、抑郁、记忆力下降，还有的会出现减弱全身对低血糖的反应。有的病人在用药的过程中，会出现味觉异常、腹泻、血胆红素的升高、胃肠胀气，还会出现尿频、夜尿增多等不良的反应。
