乙脑灭活疫苗与减毒疫苗有很大的不同之处，就是因为乙脑灭活疫苗是由死病毒制作而成，副作用比较小，要经过多次的注射，才能在婴儿体内产生抗体。
反复的注射会使婴儿的疼痛和副作用的发生率提高。乙脑减毒疫苗是一种活疫苗，有一定的免疫排斥作用，副作用比较大，但是免疫效果好，接种次数少，对孩子的危害小，更容易为父母所接受。所以，乙脑减毒疫苗优于减毒疫苗。
甲型肝炎疫苗有甲型肝炎灭活疫苗，和减毒活疫苗两大类。因为制备原理的不同，在有效性和安全性上存在差异。相对于减毒活疫苗，灭活疫苗具有更好的稳定性，而甲型肝炎减毒活疫苗的价格相对便宜。通俗一点讲，即疫苗是活的，但通常选用的是无毒或毒力很低，但免疫性很高的病毒或支原体种株培养繁殖后制成。
甲肝减毒活疫苗是指毒性减弱，但保留抗原性，相对于灭活苗，减毒活疫苗产生的免疫速度更快，效果更强烈，但具有潜在致病风险，只需接种一次。灭活疫苗是使病毒完全丧失活性，需要接种两次。
甲肝减毒活疫苗和甲肝灭活疫苗还是甲肝灭活疫苗比较好，灭活疫苗是采用技术把病毒完全杀死，而减毒活疫苗只是把病毒的毒性减低，还是存在有微毒，理论上对人体悟伤害，但病毒还是有反转的可能，对人体产生损害。
一般情况下，儿童需要打EV71型灭活疫苗。
EV71病毒是引起手足口病的主要病原，病原引起的手足口病常出现神经系统、心血管系统以及呼吸系统的重症表现，危及生命，给儿童的生命健康带来严重威胁。EV71型灭活疫苗是针对手足口病研制的预防疫苗，能有效预防EV71病毒引起的手足口病，该病毒传染性极强，临床上以儿童感染为主，所以建议五岁以下儿童能够按期接种。
乙脑灭活疫苗和减毒疫苗的主要区别在于，乙脑灭活疫苗是死病毒制成的疫苗，不良反应发较少，需要进行多次注射后，才能在宝宝体内形成抗体。多次接种又增加了宝宝的痛苦以及不良反应的发生率。而乙脑减毒疫苗属于活疫苗，存在一定的接种排斥，不良反应相对较明显，但是接种效果好，接种次数少，对宝宝的伤害减少，容易被家长接受。因此，乙脑减毒疫苗要比减毒疫苗好一些。
